RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 APBB1O00213 710 aa22.17■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 SRGAP3O43295 1099 aa22.17■■□□□ 1.14
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LTV1-201ENST00000367576 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.17■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.17■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.16■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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LTV1-201ENST00000367576 ZNF827Q17R98 1081 aa22.16■■□□□ 1.14
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LTV1-201ENST00000367576 BCL11AQ9H165 835 aa22.16■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 NARFQ9UHQ1 456 aa22.16■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 ZPR1O75312 459 aa22.15■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.15■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.15■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 SYNE4Q8N205 404 aa22.15■■□□□ 1.14
LTV1-201ENST00000367576 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.15■■□□□ 1.14
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LTV1-201ENST00000367576 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.15■■□□□ 1.14
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LTV1-201ENST00000367576 GCC1Q96CN9 775 aa22.14■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 DCTPP1Q9H773 170 aa22.14■■□□□ 1.13
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LTV1-201ENST00000367576 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.14■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 SUSD4Q5VX71 490 aa22.13■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 SSH3Q8TE77 659 aa22.13■■□□□ 1.13
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LTV1-201ENST00000367576 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 MTX1Q13505 466 aa22.12■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.12■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.12■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 FOXO4P98177 505 aa22.11■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.11■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.11■■□□□ 1.13
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LTV1-201ENST00000367576 LNPKQ9C0E8 428 aa22.11■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.11■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 ADRA2BP18089 450 aa22.1■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 NUCB1Q02818 461 aa22.1■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.1■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 SSFA2P28290 1259 aa22.1■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 PARP10Q53GL7 1025 aa22.1■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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LTV1-201ENST00000367576 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LTV1-201ENST00000367576 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.08■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 NTSR2O95665 410 aa22.08■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 PDE4AP27815 886 aa22.08■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.06■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 SIL1Q9H173 461 aa22.06■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 RGL2O15211 777 aa22.05■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.04■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 FAM161AQ3B820 660 aa22.03■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.03■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LTV1-201ENST00000367576 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.02■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
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LTV1-201ENST00000367576 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 ABCC12Q96J65 1359 aa22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 STK32BQ9NY57 414 aa22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LTV1-201ENST00000367576 LAMB2P55268 1798 aa22■■□□□ 1.11
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