RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CABP5Q9NP86 173 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP4-201ENST00000344528 DISP1Q96F81 1524 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-201ENST00000344528 TSHZ3Q63HK5 1081 aa18.97■□□□□ 0.63
SH3BP4-201ENST00000344528 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.97■□□□□ 0.63
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SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.96■□□□□ 0.63
SH3BP4-201ENST00000344528 KAT14Q9H8E8 782 aa18.96■□□□□ 0.63
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SH3BP4-201ENST00000344528 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.94■□□□□ 0.62
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SH3BP4-201ENST00000344528 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP4-201ENST00000344528 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP4-201ENST00000344528 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP4-201ENST00000344528 FSIP1Q8NA03 581 aa18.91■□□□□ 0.62
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SH3BP4-201ENST00000344528 STX8Q9UNK0 236 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-201ENST00000344528 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1328Q86T90 577 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 SBNO1A3KN83 1393 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAF1Q13077 416 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR78Q5VTH9 848 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-201ENST00000344528 DCTPP1Q9H773 170 aa18.89■□□□□ 0.61
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