RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 TCIRG1Q13488 830 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 MYD88Q99836 296 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 CDHR2Q9BYE9 1310 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 G2E3Q7L622 706 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NECTIN2Q92692 538 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 SDSP20132 328 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 CYP27B1O15528 508 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 APPP05067 770 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 TPM3P06753 285 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 PIP4K2BP78356 416 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 JCADQ9P266 1359 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NEK4P51957 841 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 CLEC4GQ6UXB4 293 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 KIF20BQ96Q89 1820 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 H3BQV1 296 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 ATP5JP18859 108 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 IFFO2Q5TF58 517 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 BTG4Q9NY30 223 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NFAT5O94916 1531 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NYXQ9GZU5 481 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 KRT24Q2M2I5 525 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 BARGINQ6ZT62 677 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 MTA3Q9BTC8 594 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SLC4A3P48751 1232 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 NGLY1Q96IV0 654 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SMC3Q9UQE7 1217 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 MPHOSPH8Q99549 860 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 WWC2Q6AWC2 1192 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SHPRHQ149N8 1683 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CHMLP26374 656 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 GSE1Q14687 1217 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 NFKBIBQ15653 356 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 TNNQ9UQP3 1299 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 H7C1W4 665 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SGSM2O43147 1006 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 RGS22Q8NE09 1264 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 LMBR1LQ6UX01 489 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CDKL5O76039 1030 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 PAF1Q8N7H5 531 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CAVIN2O95810 425 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 MYL6BP14649 208 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 TMC4Q7Z404 712 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 NEUROD6Q96NK8 337 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 SLC5A1P13866 664 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 MCM4P33991 863 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 ADRA2BP18089 450 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 USP26Q9BXU7 913 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 CNNM1Q9NRU3 951 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 LDHCP07864 332 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM29Q14134 588 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms