RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 ARMC8Q8IUR7 673 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 MIPOL1Q8TD10 442 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 CYGBQ8WWM9 190 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 PIGKQ92643 395 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 KAT2AQ92830 837 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 TANKQ92844 425 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF607Q96SK3 696 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 RUBCNLQ9H714 662 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 REEP1Q9H902 201 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 VNN3Q9NY84 501 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 USE1Q9NZ43 259 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 SNAP29O95721 258 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 ALBP02768 609 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 GABRA4P48169 554 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 GPLD1P80108 840 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 PPP2R2BQ00005 443 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 GNA13Q14344 377 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 GK3PQ14409 553 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 SLC36A3Q495N2 470 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 KRT80Q6KB66 452 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 CARFQ8N187 725 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 SMYD1Q8NB12 490 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 RDH12Q96NR8 316 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 NLGN3Q9NZ94 848 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 HYKKA2RU49 373 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 FGF17O60258 216 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 DPM1O60762 260 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 LDB3O75112 727 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 THRBP10828 461 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 ITGA2P17301 1181 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 FPR1P21462 350 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 CAPGP40121 348 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 NR1D2Q14995 579 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 MAPK11Q15759 364 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 SYPL1Q16563 259 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 AMZ1Q400G9 498 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 MS4A4EQ96PG1 132 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF347Q96SE7 839 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 SMURF2Q9HAU4 748 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 EQTNQ9NQ60 294 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXC5-201ENST00000312492 A0A1B0GTQ1 180 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 FAM227AF5H4B4 570 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 CHST10O43529 356 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 ASNA1O43681 348 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 GPR75O95800 540 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 TNFRSF1BP20333 461 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 ARL4DP49703 201 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 CRISP3P54108 245 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 ID2Q02363 134 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 EPS8Q12929 822 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 FAM53BQ14153 422 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 IQCCQ4KMZ1 466 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 KRT73Q86Y46 540 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 LGI4Q8N135 537 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 OR7G2Q8NG99 324 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 BBS10Q8TAM1 723 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 RASSF5Q8WWW0 418 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 NRBF2Q96F24 287 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 C16orf58Q96GQ5 468 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 OR7D2Q96RA2 312 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 ACTRT3Q9BYD9 372 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 ANKRA2Q9H9E1 313 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 THSD1Q9NS62 852 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 PTGFRNQ9P2B2 879 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.96■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 SCN2AQ99250 2005 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 PLOD2O00469 737 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 B4GAT1O43505 415 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 HRO43593 1189 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 HS6ST1O60243 411 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 SERPINB7O75635 380 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 TNFAIP8O95379 198 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 MYF5P13349 255 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 OR1E2P47887 323 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC5-201ENST00000312492 FAM111BQ6SJ93 734 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms