RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeastyeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DPB2YPR175W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa7.21□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W PGI1P12709 554 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W PDC5P16467 563 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W PER1P25625 357 aa7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YKL222CP35995 705 aa7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W EMC3P36039 253 aa7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W DUG1P43616 481 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YKE2P52553 114 aa7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W UBX4P54730 416 aa7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W ACM1Q08981 209 aa7.2□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W PRO1P32264 428 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W HOG1P32485 435 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W ATG14P38270 344 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W RSC8P43609 557 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YJL045WP47052 634 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SPC105P53148 917 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W GUD1Q07729 489 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W AVO1Q08236 1176 aa7.19□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SNF5P18480 905 aa7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W STO1P34160 861 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W UGA2P38067 497 aa7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YLR346CQ06139 101 aa7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W GZF3P42944 551 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W ECM9Q02202 377 aa7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W NBA1Q08229 501 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SLP1Q12232 587 aa7.17□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W BI4P03879 638 aa7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W PGM2P37012 569 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W GIC1P38785 314 aa7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SRC1Q03707 834 aa7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W MDM38Q08179 573 aa7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W GPM1P00950 247 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W CCR4P31384 837 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W SER1P33330 395 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W CCT5P40413 562 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W CCM1P48237 864 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W YMR074CQ04773 145 aa7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W GUP2Q08929 609 aa7.16□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W AEP2P22136 580 aa7.15□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W HXT6P39003 570 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W HXT7P39004 570 aa7.15□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W RPN3P40016 523 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W GYP7P48365 746 aa7.15□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W PBP1P53297 722 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
DPB2YPR175W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W SFB2P53953 876 aa7.15□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W DOT1Q04089 582 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YCL002CP25565 263 aa7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W EXO84P38261 753 aa7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W VID27P40157 782 aa7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YIR007WP40566 764 aa7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W MNN11P46985 422 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W DAM1P53267 343 aa7.14□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W SAC7P17121 654 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W NIC96P34077 839 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W EAR1Q03212 550 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W COG8Q04632 607 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YOR223WQ12015 292 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W KTR4P38131 464 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W HSE1P38753 452 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W CEM1P39525 442 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W SRT1Q03175 343 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W MTC5Q03897 1148 aa7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YSC84P32793 468 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W MAE1P36013 669 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YHL041WP38730 149 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W BRE2P43132 505 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W TAD1P53065 400 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YLL058WQ12198 575 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W TRK1P12685 1235 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W KCC4P25389 1037 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W PTP2P29461 750 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W SMY2P32909 740 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W ERP2P39704 215 aa7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W HOS3Q02959 697 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W RRP6Q12149 733 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W GPT2P36148 743 aa7.11□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W ALG14P38242 237 aa7.11□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W BIT2P38346 545 aa7.11□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W NHX1Q04121 633 aa7.11□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa7.11□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W MSS18P08593 268 aa7.1□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W NNK1P36003 928 aa7.1□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W COG4Q06096 861 aa7.1□□□□□ -1.27
DPB2YPR175W YLL054CQ12244 843 aa7.1□□□□□ -1.27
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