RNA–Protein interactions for RNA: YPR172W

YPR172W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YPR172W, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR172W	YPR172W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	NPP2	P39997	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	SHE9	Q04172	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	HSF1	P10961	833 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	PRI2	P20457	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	ATG19	P35193	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	CHA4	P43634	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	SLI1	P53304	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	SFB2	P53953	876 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	KIN4	Q01919	800 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	MSS4	P38994	779 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	OPI10	Q08202	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	NPC2	Q12408	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YPR172W	YPR172W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	EXG2	P52911	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	SCT1	P32784	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	YKL069W	P36088	180 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	VBA5	P36172	582 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
YPR172W	YPR172W	GYP7	P48365	746 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	MRP8	P35719	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	CHS7	P38843	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	YER158C	P40095	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	AIM39	Q08223	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	PPH3	P32345	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	TPO2	P53283	614 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	PBY1	P38254	753 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	NCS6	P53088	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	CTF4	Q01454	927 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	ENB1	Q08299	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	SIT1	P39980	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	GIS1	Q03833	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	GUP2	Q08929	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	VAC8	P39968	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	IRR1	P40541	1150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	LAS17	Q12446	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YPR172W	YPR172W	ADE8	P04161	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	KAR4	P25583	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	YKE2	P52553	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	RAD53	P22216	821 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	NPP1	P25353	742 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	UPC2	Q12151	913 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	SED4	P25365	1065 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	YRO2	P38079	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	AFR1	P33304	620 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	ERT1	P38140	529 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	BUL1	P48524	976 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	VPS30	Q02948	557 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	STE5	P32917	917 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	SUL1	P38359	859 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	LCD1	Q04377	747 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	PPM2	Q08282	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YPR172W	YPR172W	CDC11	P32458	415 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	RPD3	P32561	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	STE14	P32584	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	STE13	P33894	931 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	OAR1	P35731	278 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	MOH1	P38191	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	YBR184W	P38299	523 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	PFD1	P46988	109 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	UBA2	P52488	636 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	FBP1	P09201	348 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	KTR4	P38131	464 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YPR172W	YPR172W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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