RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	ARK1	P53974	638 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	ROD1	Q02805	837 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	TRK2	P28584	889 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YSC83	P32792	385 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	SPO75	Q07798	868 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	GPI13	Q07830	1017 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	ICL2	Q12031	575 aa		13.85	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	APL1	P27351	700 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	PXL1	P36166	706 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	EFM2	P38347	419 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	PLP2	Q12017	286 aa		13.84	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	POX1	P13711	748 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SEC65	P29478	273 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	YML020W	Q03722	664 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	COQ9	Q05779	260 aa		13.83	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SWI6	P09959	803 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	GPT2	P36148	743 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	OSW2	Q12202	724 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	IRE1	P32361	1115 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	EAF5	P39995	279 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	PSF2	P40359	213 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	COS5	P47187	383 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	YLR287C	Q05881	355 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	YCG1	Q06680	1035 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	NCR1	Q12200	1170 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	YEL1	P34225	687 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	MNN4	P36044	1178 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	UBP5	P39944	805 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SCS3	P53012	380 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	RTT102	P53330	157 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	KIN82	P25341	720 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	RPC25	P35718	212 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	STR2	P47164	639 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SHE10	P53075	577 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	ESC2	Q06340	456 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	IES4	Q08561	116 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	HFI1	Q12060	488 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	ATG9	Q12142	997 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	HIF1	Q12373	385 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	ECM29	P38737	1868 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	FIG4	P42837	879 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	AVT1	P47082	602 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	JJJ3	P47138	172 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	TAM41	P53230	385 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	CTR9	P89105	1077 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TRM9	YML014W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.77	□□□□□ -0.21	not detected
TRM9	YML014W	MAS2	P11914	482 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	CHS2	P14180	963 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SNA3	P14359	133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	AFT1	P22149	690 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	ERC1	P38767	581 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	RTT107	P38850	1070 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	LCB2	P40970	561 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	YJR107W	P47145	328 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	HFM1	P51979	1187 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	MSC2	Q03455	724 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	DON1	Q05610	365 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	MLH2	Q07980	695 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	HMI1	Q12039	706 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.76	□□□□□ -0.21	RIP-Chip
TRM9	YML014W	DPH2	P32461	534 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	KTR2	P33550	425 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	FLR1	P38124	548 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	VFA1	P40080	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	YAP5	P40574	245 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SMC3	P47037	1230 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	VTC3	Q02725	835 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	AIM21	P40563	679 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SKP2	P42843	763 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	STU2	P46675	888 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	ACF4	P47129	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	SUT2	Q12286	268 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	ALF1	P53904	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	TIM8	P57744	87 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TRM9	YML014W	YLR297W	Q05899	129 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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