RNA–Protein interactions for RNA: YKR011C

YKR011C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR011C, Length 1,062 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR011C	YKR011C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	ADE8	P04161	214 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	RAD4	P14736	754 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	RPC82	P32349	654 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	YER158C	P40095	573 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	GCV2	P49095	1034 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	YGR012W	P53206	393 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	CDA1	Q06702	301 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	HMI1	Q12039	706 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YKR011C	YKR011C	HSF1	P10961	833 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	NPP1	P25353	742 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	EMC1	P25574	760 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	SCT1	P32784	759 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	AFR1	P33304	620 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YRO2	P38079	344 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	POA1	P38218	177 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	ALR2	P43553	858 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	MET12	P46151	657 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	ERP6	P53198	216 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YAP6	Q03935	383 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	EAF1	Q06337	982 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	ADY3	Q07732	790 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	SRP101	P32916	621 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.7	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	HIS5	P07172	385 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	SPE1	P08432	466 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CDC11	P32458	415 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	NNF1	P47149	201 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YKE2	P52553	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	LCD1	Q04377	747 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	UBX5	Q06682	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.69	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CTS1	P29029	562 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	LST4	P34239	828 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CCC2	P38995	1004 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CHA4	P43634	648 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	TIM54	P47045	478 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	STE11	P23561	717 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	ARE1	P25628	610 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	ATG19	P35193	415 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YBR284W	P38150	797 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
YKR011C	YKR011C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	CIT1	P00890	479 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	ERT1	P38140	529 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	PLB1	P39105	664 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	TOK1	P40310	691 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	HUL5	P53119	910 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	TMA10	Q06177	86 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YKR011C	YKR011C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	REC104	P33323	182 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	PET10	P36139	283 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
YKR011C	YKR011C	IOC4	Q04213	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	BDF2	Q07442	638 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	FLC1	Q08967	793 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	TAF8	Q03750	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	NSE3	Q05541	303 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
YKR011C	YKR011C	STE13	P33894	931 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	HUL4	P40985	892 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	IOC3	P43596	787 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	TOP3	P13099	656 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	NCS6	P53088	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	NPC2	Q12408	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	PNS1	Q12412	539 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	HCM1	P25364	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YKR011C	YKR011C	DCG1	P32460	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46 ms