RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A YKL151CP36059 337 aa4.75□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A SRT1Q03175 343 aa4.75□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A YLL058WQ12198 575 aa4.75□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A YGL176CP46945 554 aa4.74□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A HRQ1Q05549 1077 aa4.74□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A TRP2P00899 507 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A POL32P47110 350 aa4.73□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data4.73□□□□□ -1.65not detected
YHL009W-AYHL009W-A ESF1Q06344 628 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A YPL066WQ12194 479 aa4.73□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A RKM4Q12504 494 aa4.73□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A TRP4P07285 380 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A FUN30P31380 1131 aa4.72□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A YKL107WP34251 309 aa4.72□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A GIC1P38785 314 aa4.72□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A TYW3P53177 273 aa4.72□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A RNT1Q02555 471 aa4.72□□□□□ -1.65
YHL009W-AYHL009W-A SAH1P39954 449 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A MUK1Q02866 612 aa4.71□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A MTH1P35198 433 aa4.7□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A FYV10P40492 516 aa4.7□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A GND2P53319 492 aa4.7□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A UPC2Q12151 913 aa4.7□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A ALG7P07286 448 aa4.69□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A SPC42P36094 363 aa4.69□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A PPR1P07272 904 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A ATE1P16639 503 aa4.68□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A SED4P25365 1065 aa4.68□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A YJR107WP47145 328 aa4.68□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A SFB2P53953 876 aa4.67□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A EEB1Q02891 456 aa4.67□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A DUT1P33317 147 aa4.66□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A SNF7P39929 240 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A YER158CP40095 573 aa4.66□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A TRM13Q12383 476 aa4.66□□□□□ -1.66
YHL009W-AYHL009W-A NPP2P39997 493 aa4.65□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A SPO20Q04359 397 aa4.65□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A NDJ1Q12366 352 aa4.65□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A PEX2P32800 271 aa4.64□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A YPR196WQ06595 470 aa4.64□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A CDC34P14682 295 aa4.63□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A RPC82P32349 654 aa4.63□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A STE14P32584 239 aa4.63□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.62□□□□□ -1.67not detected
YHL009W-AYHL009W-A RAI1P53063 387 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A RMD1Q03441 430 aa4.62□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A PET112P33893 541 aa4.61□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A SDS3P40505 327 aa4.61□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A SLU7Q02775 382 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A ERG5P54781 538 aa4.6□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A PEX19Q07418 342 aa4.6□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A CDC12P32468 407 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A PPS1P38148 807 aa4.59□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A MET10P39692 1035 aa4.59□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A GYP7P48365 746 aa4.59□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A FRE5Q08908 694 aa4.59□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
YHL009W-AYHL009W-A ESC2Q06340 456 aa4.58□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.58□□□□□ -1.68not detected
YHL009W-AYHL009W-A YHL017WP38745 532 aa4.57□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A DAS1P47005 663 aa4.57□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A NOT3P06102 836 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A MET3P08536 511 aa4.56□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A SEC21P32074 935 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A PPZ2P33329 710 aa4.56□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A DLT1Q04216 342 aa4.56□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A ABD1P32783 436 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A CTF13P35203 478 aa4.55□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A MBP1P39678 833 aa4.55□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A AFT2Q08957 416 aa4.55□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A GFA1P14742 717 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A CDC48P25694 835 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A TDP1P38319 544 aa4.54□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A ELO3P40319 345 aa4.54□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A SUT2Q12286 268 aa4.54□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A BNR1P40450 1375 aa4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A MDM10P18409 493 aa4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A STE13P33894 931 aa4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A YKR078WP36158 585 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A VPS30Q02948 557 aa4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A OYE2Q03558 400 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A SWM1Q12379 170 aa4.53□□□□□ -1.68
YHL009W-AYHL009W-A CAF20P12962 161 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A MNR2P35724 969 aa4.52□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A YGR053CP53234 283 aa4.52□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A HOF1Q05080 669 aa4.52□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A ADY4Q05955 493 aa4.52□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A TRM11Q12463 433 aa4.52□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A RIX1P38883 763 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A SDP1P40479 209 aa4.51□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A YIL108WP40483 696 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
YHL009W-AYHL009W-A KRI1P42846 591 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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