RNA–Protein interactions for RNA: YGL229C

SAP4, Transcript of Protein required for function of the Sit4p protein phosphatase, yeast

Gene SAP4, Length 2,457 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SAP4	YGL229C	PSF2	P40359	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TOS3	P43637	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	HFM1	P51979	1187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YML020W	Q03722	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DON1	Q05610	365 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CRD1	Q07560	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SMC5	Q08204	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TFC8	Q12308	588 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MSH3	P25336	1018 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SHP1	P34223	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	LDH1	P38139	375 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	REG2	P38232	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	FIR1	P40020	876 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ERG5	P54781	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ROD1	Q02805	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	VPS38	Q05919	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	KTR2	P33550	425 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SPT8	P38915	602 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ENV11	P53246	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DIP5	P53388	608 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RKM4	Q12504	494 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	PET111	P08468	800 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	COT1	P32798	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	UBP5	P39944	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	VPS53	P47061	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	UBP15	P50101	1230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SHE10	P53075	577 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	VPS62	P53285	467 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SEC65	P29478	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	IXR1	P33417	597 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CCC2	P38995	1004 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
SAP4	YGL229C	OPY2	Q06810	360 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	STE11	P23561	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	HXT1	P32465	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ATG19	P35193	415 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ARK1	P53974	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SLD5	Q03406	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DUS4	Q06063	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SPO75	Q07798	868 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MET7	Q08645	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	APL4	Q12028	832 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ATG9	Q12142	997 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TRM11	Q12463	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TRK2	P28584	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DPH2	P32461	534 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YEL043W	P32618	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	LEO1	P38439	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YAP5	P40574	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TOF1	P53840	1238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ESBP6	P53918	673 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	COQ9	Q05779	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	HFI1	Q12060	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SWI6	P09959	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	NPP2	P39997	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	HXT8	P40886	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CEP3	P40969	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	LCB2	P40970	561 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	DAS2	Q12084	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
SAP4	YGL229C	DAL7	P21826	554 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MNR2	P35724	969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	CAJ1	P39101	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	BUD16	P39988	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	ATG3	P40344	310 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	JJJ3	P47138	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	TAM41	P53230	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SAP4	YGL229C	MAL13	P53338	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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