RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	AXL1	P40851	1208 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MIC19	P43594	170 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	UBA2	P52488	636 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	ALT1	P52893	592 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MPS2	P53159	387 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MUB1	Q03162	620 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	DYN3	Q04949	312 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	ATG17	Q06410	417 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MDM36	Q06820	579 aa		3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RAD1	P06777	1100 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PEP12	P32854	288 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	BUD16	P39988	312 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MDV1	P47025	714 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SSN8	P47821	323 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	GCV2	P49095	1034 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	ERP6	P53198	216 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YPL109C	Q02981	657 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RMD1	Q03441	430 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	TRS120	Q04183	1289 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YOL036W	Q08206	761 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	CTI6	Q08923	506 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	APL4	Q12028	832 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	TAF3	Q12297	353 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	BBP1	Q12365	385 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	TCB1	Q12466	1186 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	FKS3	Q04952	1785 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	JIP3	O13555	125 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PDE2	P06776	526 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PKC1	P24583	1151 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	CBF2	P32504	956 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PEP7	P32609	515 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	CNS1	P33313	385 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SLA2	P33338	968 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SLX8	P40072	274 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	VTC2	P43585	828 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	STR2	P47164	639 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	HFM1	P51979	1187 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	HXT17	P53631	564 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	ALF1	P53904	254 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	GTR1	Q00582	310 aa		3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	LAM4	P38800	1345 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	OCA4	P25366	362 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PTR2	P32901	601 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	ATG19	P35193	415 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PEX18	P38855	283 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PIK1	P39104	1066 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MEP1	P40260	492 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	IES1	P43579	692 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	APS3	P47064	194 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SRB7	P47822	140 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MON1	P53129	644 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	UFD2	P54860	961 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	WAR1	Q03631	944 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	THI22	Q06490	572 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RSC3	Q06639	885 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	TMA16	Q08687	178 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	VAN1	P23642	535 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	KIP1	P28742	1111 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	UGA2	P38067	497 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PTC4	P38089	393 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	MRX3	P38172	270 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SLX1	P38324	304 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RRM3	P38766	723 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YJR054W	P47114	497 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	GPI8	P49018	411 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	PEX14	P53112	341 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YNL144C	P53907	740 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	FIN1	Q03898	291 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	YPQ2	Q06328	317 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SOG2	Q08817	791 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	NUR1	Q12066	484 aa		3.85	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	GCN3	P14741	305 aa		3.84	□□□□□ -1.79
XRS2	YDR369C	SEC2	P17065	759 aa		3.84	□□□□□ -1.79

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