RNA–Protein interactions for RNA: YBL008W-A

YBL008W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YBL008W-A, Length 240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL008W-AYBL008W-A HXT13P39924 564 aa2.96□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A HXT17P53631 564 aa2.96□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A HXT15P54854 567 aa2.96□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A SLU7Q02775 382 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A MRPS35P53292 345 aa2.95□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A MRI1Q06489 411 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A OXR1Q08952 273 aa2.95□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A ECM21P38167 1117 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A ERP5P38819 212 aa2.94□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A NOP1P15646 327 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A KIN3P22209 435 aa2.93□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A ORC2P32833 620 aa2.93□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A GNT1Q12096 491 aa2.93□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A STE14P32584 239 aa2.92□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A ADY4Q05955 493 aa2.92□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A RGT2Q12300 763 aa2.92□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A HXK1P04806 485 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A STE4P18851 423 aa2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A SEC8P32855 1065 aa2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A PNT1P38969 423 aa2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A MEP2P41948 499 aa2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A RIM13Q03792 727 aa2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A SUB2Q07478 446 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
YBL008W-AYBL008W-A MET3P08536 511 aa2.9□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A SED4P25365 1065 aa2.9□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A PCL5P38794 229 aa2.9□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A ELO3P40319 345 aa2.9□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A MPS1P54199 764 aa2.9□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A GNP1P48813 663 aa2.89□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A DLT1Q04216 342 aa2.89□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A MCM7P38132 845 aa2.88□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A DMA2P53924 522 aa2.88□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A APM1Q00776 475 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A CIR2Q08822 631 aa2.88□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A YBL113CQ7M4S9 792 aa2.88□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A BNA3P47039 444 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
YBL008W-AYBL008W-A SEG1Q04279 960 aa2.87□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A PEX19Q07418 342 aa2.87□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A MDM38Q08179 573 aa2.87□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A SPO11P23179 398 aa2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A PTP1P25044 335 aa2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A FUN30P31380 1131 aa2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A CTF13P35203 478 aa2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A SRT1Q03175 343 aa2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A SPP382Q06411 708 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A YKL151CP36059 337 aa2.85□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A GIC1P38785 314 aa2.85□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A TIF35Q04067 274 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A YLL058WQ12198 575 aa2.85□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A CAF20P12962 161 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A MRL1Q06815 381 aa2.84□□□□□ -1.95
YBL008W-AYBL008W-A HOM2P13663 365 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A PRE9P23638 258 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A DMC1P25453 334 aa2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A NET1P47035 1189 aa2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A HRQ1Q05549 1077 aa2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A MCD1Q12158 566 aa2.83□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A RIA1P53893 1110 aa2.82□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A MET4P32389 672 aa2.81□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A MRPS18P42847 217 aa2.81□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A CRR1Q05790 422 aa2.81□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A EMP70P32802 667 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A RER2P35196 286 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A LTP1P40347 161 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A YJL163CP46996 555 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A MUP1P50276 574 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A DAM1P53267 343 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A TRM11Q12463 433 aa2.8□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A NPP2P39997 493 aa2.79□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A GCR1P07261 785 aa2.78□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A VPS34P22543 875 aa2.78□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A YEL020CP39994 560 aa2.78□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A FKH2P41813 862 aa2.78□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A YGL176CP46945 554 aa2.78□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A SFB2P53953 876 aa2.78□□□□□ -1.96
YBL008W-AYBL008W-A YBR053CP38235 358 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A YHL050CP38721 697 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A YHR219WP38900 624 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A YJL206CP39529 758 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A GEP3Q08622 556 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A OSW1Q08692 278 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A YLR149CQ99296 730 aa2.77□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A RPT1P33299 467 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A CBR1P38626 284 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A XBP1P40489 647 aa2.76□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A RAI1P53063 387 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A YGR053CP53234 283 aa2.76□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data2.76□□□□□ -1.97not detected
YBL008W-AYBL008W-A TAF3Q12297 353 aa2.76□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A RPN13O13563 156 aa2.75□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A RPC82P32349 654 aa2.75□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A TUB3P09734 445 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A SSL2Q00578 843 aa2.74□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A RLF2Q12495 606 aa2.74□□□□□ -1.97
YBL008W-AYBL008W-A YGR122WP53272 402 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.5 ms