RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	IFT57	Q9NWB7	429 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		21.54	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	21.53	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		21.53	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBIP	Q9NS73	344 aa		21.53	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM177B	A6PVY3	158 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	HLF	Q16534	295 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	KRT24	Q2M2I5	525 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		21.52	■■□□□ 1.04
JMJD1C-211	ENST00000633035	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	21.51	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		21.51	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	HOXB7	P09629	217 aa		21.51	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		21.51	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF853	P0CG23	659 aa		21.5	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		21.5	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTLL6	Q8N841	843 aa		21.5	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	21.5	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	21.5	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	21.5	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		21.49	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANXA1	P04083	346 aa		21.49	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	21.49	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDIA6	Q15084	440 aa		21.49	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC27	Q2M243	656 aa		21.49	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		21.48	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	COPS6	Q7L5N1	327 aa		21.48	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		21.48	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	NYX	Q9GZU5	481 aa		21.48	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	21.48	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		21.48	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	PROSER3	Q2NL68	480 aa		21.47	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	21.47	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	WWC1	Q8IX03	1113 aa		21.47	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	21.47	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPT	P24298	496 aa		21.46	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		21.46	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		21.46	■■□□□ 1.03
JMJD1C-211	ENST00000633035	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		21.44	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		21.44	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CNKSR1	Q969H4	720 aa		21.44	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	HYPK	Q9NX55	129 aa		21.44	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		21.43	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	MASTL	Q96GX5	879 aa		21.43	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARP10	Q53GL7	1025 aa		21.42	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	STYK1	Q6J9G0	422 aa		21.42	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		21.42	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP10D	Q9P241	1426 aa		21.42	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	IL16	Q14005	1332 aa		21.41	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SRGN	P10124	158 aa		21.41	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		21.41	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUSD4	Q5VX71	490 aa		21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	WDR63	Q8IWG1	891 aa		21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NUP98	P52948	1817 aa		21.39	■■□□□ 1.02
JMJD1C-211	ENST00000633035	NPR1	P16066	1061 aa		21.39	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERFE	Q4G0M1	354 aa		21.39	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		21.39	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	C21orf2	O43822	256 aa		21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCIRG1	Q13488	830 aa		21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		21.38	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ALDH1B1	P30837	517 aa		21.37	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		21.37	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	GOLGA2	Q08379	1002 aa		21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	SOGA3	Q5TF21	947 aa		21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	STK31	Q9BXU1	1019 aa		21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF181	Q9P0P0	153 aa		21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSPYL6	Q8N831	410 aa		21.35	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		21.35	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	NTSR2	O95665	410 aa		21.34	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	NLRP3	Q96P20	1036 aa		21.34	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	21.34	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	RASSF7	Q02833	373 aa		21.33	■■□□□ 1.01
JMJD1C-211	ENST00000633035	NLRP10	Q86W26	655 aa		21.33	■■□□□ 1.01

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