RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623498.3

SEM1-223, Transcript of SEM1, 26S proteasome complex subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene SEM1, Length 582 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEM1-223	ENST00000623498	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498		A0A087WZG4	1122 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498		F6X3S4	739 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	NUP98	P52948	1817 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	APBA3	O96018	575 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	BAG6	P46379	1132 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ADCY9	O60503	1353 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	C4B	P0C0L5	1744 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	RGL2	O15211	777 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	RPS6KA4	O75676	772 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	GNAI3	P08754	354 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SEM1-223	ENST00000623498	EP400	Q96L91	3159 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	KCNQ4	P56696	695 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	TCIRG1	Q13488	830 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	AK7	Q96M32	723 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	ARX	Q96QS3	562 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	MYD88	Q99836	296 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	COL15A1	P39059	1388 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	GNPAT	O15228	680 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	PROM2	Q8N271	834 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	GNAI2	P04899	355 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	IGKV5-2	P06315	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	GCKR	Q14397	625 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	UTY	O14607	1347 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	GRM8	O00222	908 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	MEIS3	Q99687	375 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	ZPR1	O75312	459 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	SSFA2	P28290	1259 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	SCN7A	Q01118	1682 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	HMMR	O75330	724 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	RFC4	P35249	363 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	C1QTNF8	P60827	252 aa		11.15	□□□□□ -0.62
SEM1-223	ENST00000623498	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62

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