RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SOGA3	Q5TF21	947 aa		13.31	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	PTPRT	O14522	1441 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT24	Q2M2I5	525 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.3	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF1B	O60333	1816 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	OFD1	O75665	1012 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	NAPB	Q9H115	298 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	IL13	P35225	146 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCF2	Q9UG63	623 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP10A	O60312	1499 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ANAPC15	P60006	121 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	MAP3K12	Q12852	859 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		13.29	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CTAGE5	O15320	804 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	UBE2H	P62256	183 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	HOXC9	P31274	260 aa		13.27	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.27	□□□□□ -0.28
AKAP9-216	ENST00000619023	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.27	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.27	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.27	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.27	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	GPT	P24298	496 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	EYA1	Q99502	592 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CHD1	O14646	1710 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	GRM8	O00222	908 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ADCY5	O95622	1261 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	STX1A	Q16623	288 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	USP5	P45974	858 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	DEF6	Q9H4E7	631 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
AKAP9-216	ENST00000619023	CDR1	P51861	262 aa		13.24	□□□□□ -0.29

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