RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 MASTLQ96GX5 879 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 PRDM10Q9NQV6 1147 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 BCORQ6W2J9 1755 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 CAMTA2O94983 1202 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 A1BGP04217 495 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 AIDAQ96BJ3 306 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 IL17REQ8NFR9 667 aa24.47■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 VEGFBP49765 207 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2C-208ENST00000617055 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC93Q567U6 631 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.44■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.42■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 WBP1LQ9NX94 342 aa24.41■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.41■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 NPR1P16066 1061 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 HACL1Q9UJ83 578 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.4■■□□□ 1.5
UBE2C-208ENST00000617055 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 KCNQ3O43525 872 aa24.39■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 LBX1P52954 281 aa24.39■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.39■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 EPHX2P34913 555 aa24.38■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.38■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 BTBD11A6QL63 1104 aa24.37■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.37■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.37■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.36■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 OLFM4Q6UX06 510 aa24.36■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 USP16Q9Y5T5 823 aa24.36■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 RASSF10A6NK89 507 aa24.35■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 DEFB115Q30KQ5 88 aa24.35■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 CNTROBQ8N137 903 aa24.35■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.35■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.34■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 IARSP41252 1262 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
UBE2C-208ENST00000617055 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.32■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 FZD9O00144 591 aa24.32■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 GPC2Q8N158 579 aa24.31■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 SYNE4Q8N205 404 aa24.31■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 FAM177BA6PVY3 158 aa24.3■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 ALDH1B1P30837 517 aa24.3■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 ABHD8Q96I13 439 aa24.3■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.3■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 RGL2O15211 777 aa24.29■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 PRKAR2BP31323 418 aa24.28■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF26B4DH59 902 aa24.27■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF15Q8N660 670 aa24.27■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 JDP2Q8WYK2 163 aa24.27■■□□□ 1.48
UBE2C-208ENST00000617055 SLC34A2O95436 690 aa24.26■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 PSMD1Q99460 953 aa24.26■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.26■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 SNED1Q8TER0 1413 aa24.26■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 FAM161AQ3B820 660 aa24.25■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.25■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 THSD7BQ9C0I4 1608 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 LTBP1Q14766 1721 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.24■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 HLFQ16534 295 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 MCM10Q7L590 875 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 COL4A5P29400 1685 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.23■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 CRY2Q49AN0 593 aa24.22■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 CAPNS2Q96L46 248 aa24.22■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 ABCC12Q96J65 1359 aa24.21■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.21■■□□□ 1.47
UBE2C-208ENST00000617055 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms