RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 BACH2Q9BYV9 841 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.42■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 GRM8O00222 908 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 SSH3Q8TE77 659 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 MYD88Q99836 296 aa28.4■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
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CAPNS1-207ENST00000589146 POLA2Q14181 598 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 GCKRQ14397 625 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.39■■■□□ 2.14
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM161AQ3B820 660 aa28.38■■■□□ 2.13
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CAPNS1-207ENST00000589146 COL15A1P39059 1388 aa28.37■■■□□ 2.13
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.37■■■□□ 2.13
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CAPNS1-207ENST00000589146 NHSQ6T4R5 1651 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-207ENST00000589146 PALLDQ8WX93 1383 aa28.36■■■□□ 2.13
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.35■■■□□ 2.13
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CAPNS1-207ENST00000589146 SIK1P57059 783 aa28.35■■■□□ 2.13
CAPNS1-207ENST00000589146 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
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CAPNS1-207ENST00000589146 C8orf34Q49A92 452 aa28.33■■■□□ 2.13
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CAPNS1-207ENST00000589146 KAZALD1Q96I82 304 aa28.31■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 SUCLG2Q96I99 432 aa28.31■■■□□ 2.12
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CAPNS1-207ENST00000589146 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.3■■■□□ 2.12
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CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.29■■■□□ 2.12
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CAPNS1-207ENST00000589146 RAB11FIP3O75154 756 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 CASP7P55210 303 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 TCIRG1Q13488 830 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ITPK1Q13572 414 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-207ENST00000589146 SRGAP3O43295 1099 aa28.27■■■□□ 2.12
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CAPNS1-207ENST00000589146 LRRCC1Q9C099 1032 aa28.24■■■□□ 2.11
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CAPNS1-207ENST00000589146 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-207ENST00000589146 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.22■■■□□ 2.11
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CAPNS1-207ENST00000589146 LY75O60449 1722 aa28.18■■■□□ 2.1
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CAPNS1-207ENST00000589146 HLFQ16534 295 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM182BQ5T319 152 aa28.16■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 RGL2O15211 777 aa28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXO4P98177 505 aa28.15■■■□□ 2.1
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