RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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DNMT1-208ENST00000586667 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
DNMT1-208ENST00000586667 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.1■□□□□ 0.17
DNMT1-208ENST00000586667 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
DNMT1-208ENST00000586667 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
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DNMT1-208ENST00000586667 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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DNMT1-208ENST00000586667 FKBP8Q14318 412 aa16.04■□□□□ 0.16
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DNMT1-208ENST00000586667 ZNF652Q9Y2D9 606 aa16■□□□□ 0.15
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DNMT1-208ENST00000586667 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa15.97■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 MSH5O43196 834 aa15.97■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 NTSR2O95665 410 aa15.97■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.97■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 ALDH1L1O75891 902 aa15.96■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 GCKRQ14397 625 aa15.96■□□□□ 0.15
DNMT1-208ENST00000586667 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
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