RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 COPS6Q7L5N1 327 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-208ENST00000566059 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 HYPKQ9NX55 129 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 HLFQ16534 295 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 SCN7AQ01118 1682 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 NFIXQ14938 502 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 RGL2O15211 777 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 DDR1Q08345 913 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 STK31Q9BXU1 1019 aa23.04■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 BCORQ6W2J9 1755 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 SLC4A2P04920 1241 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.03■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.02■■□□□ 1.28
SPNS1-208ENST00000566059 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 G2E3Q7L622 706 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 SETDB2Q96T68 719 aa23■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.99■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 SERPINB2P05120 415 aa22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 KLHL34Q8N239 644 aa22.97■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 ATP10DQ9P241 1426 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 SYT17Q9BSW7 474 aa22.96■■□□□ 1.27
SPNS1-208ENST00000566059 NUP98P52948 1817 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 GPTP24298 496 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 FLIIQ13045 1269 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF428Q96B54 188 aa22.95■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.94■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 TCIRG1Q13488 830 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.93■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 KSR2Q6VAB6 950 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 FAM177BA6PVY3 158 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 ADCY9O60503 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 SUSD4Q5VX71 490 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 PARP10Q53GL7 1025 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 CNBD1Q8NA66 436 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 CACNA1FO60840 1977 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-208ENST00000566059 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 NLRP10Q86W26 655 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 MYD88Q99836 296 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 NPHP1O15259 732 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 NTSR2O95665 410 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 NYXQ9GZU5 481 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 TGFB2P61812 414 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 ST5P78524 1137 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 A0A0G2JLW4 131 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 F6X3S4 739 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-208ENST00000566059 ERFEQ4G0M1 354 aa22.84■■□□□ 1.25
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