RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558639.5

PSMA4-208, Transcript of proteasome subunit alpha 4, human

TSL 3

Gene PSMA4, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA4-208	ENST00000558639	PSME1	Q06323	249 aa		10.91	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	AGER	Q15109	404 aa		10.91	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		10.91	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	ABCC11	Q96J66	1382 aa		10.9	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.9	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	PRAM1	Q96QH2	718 aa		10.9	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	RGS12	O14924	1447 aa		10.9	□□□□□ -0.66
PSMA4-208	ENST00000558639	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	BAP1	Q92560	729 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.88	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		10.88	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ATP9B	O43861	1147 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		10.87	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.86	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PIK3C2G	O75747	1445 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639		A0A0G2JS52	829 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	MYT1	Q01538	1121 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PDE4C	Q08493	712 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		10.85	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	PXDN	Q92626	1479 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	TECPR2	O15040	1411 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	ATRN	O75882	1429 aa		10.84	□□□□□ -0.67
PSMA4-208	ENST00000558639	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SKI	P12755	728 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	LAMC1	P11047	1609 aa		10.83	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	FOXJ1	Q92949	421 aa		10.82	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	MYOM2	P54296	1465 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM83G	A6ND36	823 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	IFT172	Q9UG01	1749 aa		10.81	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SH3BP2	P78314	561 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	TRIM32	Q13049	653 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	VPS72	Q15906	364 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	BTG4	Q9NY30	223 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	SBNO1	A3KN83	1393 aa		10.77	□□□□□ -0.68
PSMA4-208	ENST00000558639	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		10.77	□□□□□ -0.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms