RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.17■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTH1RQ03431 593 aa24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDIA6Q15084 440 aa24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.16■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 AK2P54819 239 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 TTC14Q96N46 770 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 AACSQ86V21 672 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.15■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRM8O00222 908 aa24.14■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYL6BP14649 208 aa24.14■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 HYPKQ9NX55 129 aa24.14■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERBB3P21860 1342 aa24.14■■□□□ 1.46
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCHHQ07283 1943 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 RUFY3Q7L099 469 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 LINS1Q8NG48 757 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIL1Q9H173 461 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 SASH1O94885 1247 aa24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 IGKV5-2P06315 115 aa24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 LARGE1O95461 756 aa24.11■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF790Q6PG37 636 aa24.11■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.11■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 TPRNQ4KMQ1 711 aa24.1■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.1■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.1■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.09■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.09■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.09■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM227BQ96M60 508 aa24.09■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.08■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 MBD3O95983 291 aa24.08■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP48Q86UV5 1035 aa24.08■■□□□ 1.45
AFG3L1P-217ENST00000557444 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 RNF214Q8ND24 703 aa24.08■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 GPATCH3Q96I76 525 aa24.08■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.08■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.08■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.07■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.07■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.07■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.07■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 UTYO14607 1347 aa24.06■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 C5P01031 1676 aa24.06■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 COPS6Q7L5N1 327 aa24.06■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.06■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 EVI5LQ96CN4 794 aa24.05■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYD88Q99836 296 aa24.05■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.05■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHKG2P15735 406 aa24.05■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 SYT1P21579 422 aa24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 USP16Q9Y5T5 823 aa24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.04■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHRNA2Q15822 529 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 MEGF6O75095 1541 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 HDAC5Q9UQL6 1122 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.03■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCKRQ14397 625 aa24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 NECTIN1Q15223 517 aa24.02■■□□□ 1.44
AFG3L1P-217ENST00000557444 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
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