RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	FSTL1	Q12841	308 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.41	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	SRGN	P10124	158 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.39	■■■□□ 2.78
PPP4R4-204	ENST00000555690	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.38	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.37	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	HTRA3	P83110	453 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	HLF	Q16534	295 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLX4	Q8IY92	1834 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	RGL2	O15211	777 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PPP4R4-204	ENST00000555690	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	NPR1	P16066	1061 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	SOGA3	Q5TF21	947 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	POTEC	B2RU33	542 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PPP4R4-204	ENST00000555690	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYL6B	P14649	208 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	RALBP1	Q15311	655 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC93	Q567U6	631 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	OLFM4	Q6UX06	510 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	RIPK4	P57078	832 aa		32.2	■■■□□ 2.75
PPP4R4-204	ENST00000555690	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	GPT	P24298	496 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	ALDH1B1	P30837	517 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.16	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	NUP98	P52948	1817 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	PCNT	O95613	3336 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	JMY	Q8N9B5	988 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4R4-204	ENST00000555690	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	POTEI	P0CG38	1075 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	POTEJ	P0CG39	1038 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	PDIA6	Q15084	440 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHADL	Q6NUI6	762 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.73
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANXA1	P04083	346 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	PROSER3	Q2NL68	480 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PPP4R4-204	ENST00000555690	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72

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