RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 STYK1Q6J9G0 422 aa24.77■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 NBPF15Q8N660 670 aa24.77■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 CACNA1SQ13698 1873 aa24.77■■□□□ 1.56
LTBR-211ENST00000543190 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.76■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 GLTPD2A6NH11 291 aa24.76■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 SRGNP10124 158 aa24.76■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 RASSF7Q02833 373 aa24.76■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 DCTN1Q14203 1278 aa24.76■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 NEFMP07197 916 aa24.75■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.75■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 CNKSR1Q969H4 720 aa24.75■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 ST5P78524 1137 aa24.74■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 SOGA3Q5TF21 947 aa24.74■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 NFE2L2Q16236 605 aa24.73■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 MASTLQ96GX5 879 aa24.72■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 RALBP1Q15311 655 aa24.71■■□□□ 1.55
LTBR-211ENST00000543190 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 RRAGCQ9HB90 399 aa24.7■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.69■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.69■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 ERBB4Q15303 1308 aa24.68■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 C21orf2O43822 256 aa24.68■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.67■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 NPR1P16066 1061 aa24.66■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 DPY19L2Q6NUT2 758 aa24.66■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.66■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.65■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.65■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 SCN4AP35499 1836 aa24.65■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 PCNTO95613 3336 aa24.64■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 NPHP1O15259 732 aa24.64■■□□□ 1.54
LTBR-211ENST00000543190 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.63■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 POTECB2RU33 542 aa24.63■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 CRY2Q49AN0 593 aa24.63■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 ERFEQ4G0M1 354 aa24.63■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.62■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 HLFQ16534 295 aa24.62■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 SNED1Q8TER0 1413 aa24.61■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 JMYQ8N9B5 988 aa24.61■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 NYXQ9GZU5 481 aa24.61■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 ALDH1B1P30837 517 aa24.6■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 CCDC93Q567U6 631 aa24.6■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 IFFO2Q5TF58 517 aa24.6■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 KLRG1Q96E93 195 aa24.6■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.59■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 RTKN2Q8IZC4 609 aa24.58■■□□□ 1.53
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.57■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.57■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 GRIPAP1Q4V328 841 aa24.56■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.56■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.56■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 RIPK4P57078 832 aa24.55■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa24.55■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.55■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 PDIA6Q15084 440 aa24.54■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 PSMD1Q99460 953 aa24.54■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.54■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 ABCC12Q96J65 1359 aa24.54■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.53■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.53■■□□□ 1.52
LTBR-211ENST00000543190 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.51■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 PARP10Q53GL7 1025 aa24.51■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa24.5■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 NTSR2O95665 410 aa24.5■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.5■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 CHL1O00533 1208 aa24.49■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 MYL6BP14649 208 aa24.49■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.49■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 FZD9O00144 591 aa24.48■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 SUSD4Q5VX71 490 aa24.47■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.47■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.47■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.47■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 LAMB2P55268 1798 aa24.47■■□□□ 1.51
LTBR-211ENST00000543190 HOXB7P09629 217 aa24.46■■□□□ 1.51
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