RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539477.5

MLH1-222, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2 BASIC

Gene MLH1, Length 2,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-222	ENST00000539477	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	G2E3	Q7L622	706 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477		E9PSI1	815 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	ADRA2B	P18089	450 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	DDR1	Q08345	913 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	COPS6	Q7L5N1	327 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	NARF	Q9UHQ1	456 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	VAMP4	O75379	141 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	GPT	P24298	496 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	11.97	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	NFIX	Q14938	502 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	TAF1	P21675	1872 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MLH1-222	ENST00000539477	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	HOXB7	P09629	217 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	POLD1	P28340	1107 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477		F6X3S4	739 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	STK31	Q9BXU1	1019 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	LAMB2	P55268	1798 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	ADCY9	O60503	1353 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477		A0A087WZG4	1122 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	TM4SF1	P30408	202 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	FLII	Q13045	1269 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	HYPK	Q9NX55	129 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	NPHP1	O15259	732 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	SERPINB2	P05120	415 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	SETDB2	Q96T68	719 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.9	□□□□□ -0.5
MLH1-222	ENST00000539477	BCAR3	O75815	825 aa		11.9	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SYT17	Q9BSW7	474 aa		11.9	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.9	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.9	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	MYD88	Q99836	296 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	MYH3	P11055	1940 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CHRNA5	P30532	468 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SUSD4	Q5VX71	490 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SLC51A	Q86UW1	340 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	PCNT	O95613	3336 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477		A0A0G2JLW4	131 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CNBD1	Q8NA66	436 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	SPEF2	Q9C093	1822 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	COL4A1	P02462	1669 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
MLH1-222	ENST00000539477	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51

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