RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa31.9■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 ZNF652Q9Y2D9 606 aa31.9■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 NEFMP07197 916 aa31.89■■■□□ 2.7
ACER3-211ENST00000531461 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 STYK1Q6J9G0 422 aa31.88■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 CCDC24Q8N4L8 307 aa31.88■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 CNKSR1Q969H4 720 aa31.88■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 KDM3BQ7LBC6 1761 aa31.88■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 SLX4Q8IY92 1834 aa31.87■■■□□ 2.69
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ACER3-211ENST00000531461 SRGNP10124 158 aa31.87■■■□□ 2.69
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ACER3-211ENST00000531461 NBPF15Q8N660 670 aa31.87■■■□□ 2.69
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ACER3-211ENST00000531461 NPHP1O15259 732 aa31.86■■■□□ 2.69
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ACER3-211ENST00000531461 C21orf2O43822 256 aa31.85■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 MASTLQ96GX5 879 aa31.85■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 CACNA1SQ13698 1873 aa31.84■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
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ACER3-211ENST00000531461 SMC1BQ8NDV3 1235 aa31.83■■■□□ 2.69
ACER3-211ENST00000531461 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 SOGA3Q5TF21 947 aa31.82■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP31.82■■■□□ 2.68
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ACER3-211ENST00000531461 NFE2L2Q16236 605 aa31.8■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 IFFO2Q5TF58 517 aa31.8■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.8■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 TAOK3Q9H2K8 898 aa31.8■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 MIS18AQ9NYP9 233 aa31.8■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 DPY19L2Q6NUT2 758 aa31.79■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 ERFEQ4G0M1 354 aa31.78■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
ACER3-211ENST00000531461 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 C7orf43Q8WVR3 580 aa31.76■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 NUP98P52948 1817 aa31.76■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 NPR1P16066 1061 aa31.75■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 POTECB2RU33 542 aa31.74■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 ERVV-1B6SEH8 477 aa31.74■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 HLFQ16534 295 aa31.74■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 KLRG1Q96E93 195 aa31.73■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa31.73■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 RALBP1Q15311 655 aa31.7■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 CCDC93Q567U6 631 aa31.7■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 JMYQ8N9B5 988 aa31.7■■■□□ 2.67
ACER3-211ENST00000531461 HTRA3P83110 453 aa31.69■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
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ACER3-211ENST00000531461 NYXQ9GZU5 481 aa31.68■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 ERBB4Q15303 1308 aa31.68■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
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ACER3-211ENST00000531461 RIC1Q4ADV7 1423 aa31.66■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 CRY2Q49AN0 593 aa31.65■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 KIF6Q6ZMV9 814 aa31.65■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 BABAM1Q9NWV8 329 aa31.65■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 FAM177BA6PVY3 158 aa31.64■■■□□ 2.66
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ACER3-211ENST00000531461 RTKN2Q8IZC4 609 aa31.64■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
ACER3-211ENST00000531461 SCN4AP35499 1836 aa31.63■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.63■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 NGEFQ8N5V2 710 aa31.63■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 PCNTO95613 3336 aa31.62■■■□□ 2.65
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ACER3-211ENST00000531461 ABCC12Q96J65 1359 aa31.6■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 MYL6BP14649 208 aa31.6■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 RIPK4P57078 832 aa31.6■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
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ACER3-211ENST00000531461 UBN2Q6ZU65 1347 aa31.58■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.58■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 ZNF34Q8IZ26 560 aa31.58■■■□□ 2.65
ACER3-211ENST00000531461 IQCA1LA6NCM1 817 aa31.57■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.57■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 NUTM1Q86Y26 1132 aa31.57■■■□□ 2.64
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ACER3-211ENST00000531461 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa31.56■■■□□ 2.64
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ACER3-211ENST00000531461 CHADLQ6NUI6 762 aa31.55■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 OLFM4Q6UX06 510 aa31.55■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 PSMD1Q99460 953 aa31.55■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
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ACER3-211ENST00000531461 SUSD4Q5VX71 490 aa31.54■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 GPTP24298 496 aa31.53■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 GRIPAP1Q4V328 841 aa31.53■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 NTSR2O95665 410 aa31.52■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 IARSP41252 1262 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 PARP10Q53GL7 1025 aa31.52■■■□□ 2.64
ACER3-211ENST00000531461 FZD9O00144 591 aa31.51■■■□□ 2.63
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa31.51■■■□□ 2.63
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