RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871	STYK1	Q6J9G0	422 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	ST5	P78524	1137 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	HLF	Q16534	295 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		32.24	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	NEFM	P07197	916 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	FSTL1	Q12841	308 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	CNKSR1	Q969H4	720 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	MASTL	Q96GX5	879 aa		32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	SLX4	Q8IY92	1834 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		32.22	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	32.21	■■■□□ 2.75	not detected	■□□□□ 9
RPS2-208	ENST00000527871	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
RPS2-208	ENST00000527871	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		32.2	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	POTEC	B2RU33	542 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	NPHP1	O15259	732 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	RALBP1	Q15311	655 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		32.15	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	NPR1	P16066	1061 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	HTRA3	P83110	453 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		32.14	■■■□□ 2.74
RPS2-208	ENST00000527871	NGEF	Q8N5V2	710 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		32.12	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	SOGA3	Q5TF21	947 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.11	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	RIPK4	P57078	832 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	PCNT	O95613	3336 aa		32.1	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.09	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
RPS2-208	ENST00000527871	MYL6B	P14649	208 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	OLFM4	Q6UX06	510 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	CACNA1S	Q13698	1873 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	PDIA6	Q15084	440 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	CRY2	Q49AN0	593 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		32.06	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	NUP98	P52948	1817 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC93	Q567U6	631 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	ERBB4	Q15303	1308 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	KLRG1	Q96E93	195 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	NYX	Q9GZU5	481 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	ALDH1B1	P30837	517 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.01	■■■□□ 2.72
RPS2-208	ENST00000527871	GPT	P24298	496 aa		32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	32.01	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	JMY	Q8N9B5	988 aa		32	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	SNED1	Q8TER0	1413 aa		32	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	PROSER3	Q2NL68	480 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	NTSR2	O95665	410 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		31.97	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.96	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	CHL1	O00533	1208 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	ANXA1	P04083	346 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	POTEI	P0CG38	1075 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	POTEJ	P0CG39	1038 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
RPS2-208	ENST00000527871	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.94	■■■□□ 2.7

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