RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-217	ENST00000524534	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		13.77	□□□□□ -0.2
PTPRK-217	ENST00000524534	AP5Z1	O43299	807 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PTH1R	Q03431	593 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	HOXB7	P09629	217 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	NLRP6	P59044	892 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	MTX1	Q13505	466 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	DIP2A	Q14689	1571 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	TPM3	P06753	285 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ME3	Q16798	604 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ADCY9	O60503	1353 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	TSC1	Q92574	1164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ELP1	O95163	1332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	DTNB	O60941	627 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	NECAB1	Q8N987	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	ARID3A	Q99856	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPRK-217	ENST00000524534	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	KRT85	P78386	507 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	KCNQ3	O43525	872 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	MAP3K11	Q16584	847 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	HIP1	O00291	1037 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	ANXA1	P04083	346 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	LIG1	P18858	919 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	PSMA5	P28066	241 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	SPC24	Q8NBT2	197 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
PTPRK-217	ENST00000524534	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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