RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515760.1

PEX10-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 10, human

TSL 4

Gene PEX10, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX10-208	ENST00000515760	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PEX10-208	ENST00000515760	MCM10	Q7L590	875 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PEX10-208	ENST00000515760	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PEX10-208	ENST00000515760	USP16	Q9Y5T5	823 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PEX10-208	ENST00000515760	PPP2R1A	P30153	589 aa		27.95	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	JMY	Q8N9B5	988 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	CNKSR1	Q969H4	720 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	SRGN	P10124	158 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	DCTN1	Q14203	1278 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	PCNT	O95613	3336 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	POTEC	B2RU33	542 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PEX10-208	ENST00000515760	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	SOGA3	Q5TF21	947 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	NBPF26	B4DH59	902 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	NBPF15	Q8N660	670 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.84	■■■□□ 2.05
PEX10-208	ENST00000515760	RGL2	O15211	777 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	NPR1	P16066	1061 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	CCDC93	Q567U6	631 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	SCN4A	P35499	1836 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	NUP98	P52948	1817 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	NEFM	P07197	916 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	HLF	Q16534	295 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PEX10-208	ENST00000515760	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.75	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	OLFM4	Q6UX06	510 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	NGEF	Q8N5V2	710 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PEX10-208	ENST00000515760	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	CREBZF	Q9NS37	354 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	ALDH1B1	P30837	517 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	NFE2L2	Q16236	605 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	TNS4	Q8IZW8	715 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	SNED1	Q8TER0	1413 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	MYL6B	P14649	208 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	GPT	P24298	496 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	SYNE4	Q8N205	404 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PEX10-208	ENST00000515760	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PEX10-208	ENST00000515760	CAPN15	O75808	1086 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEX10-208	ENST00000515760	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PEX10-208	ENST00000515760	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEX10-208	ENST00000515760	COL4A5	P29400	1685 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PEX10-208	ENST00000515760	FZD9	O00144	591 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PEX10-208	ENST00000515760	PSMD1	Q99460	953 aa		27.61	■■■□□ 2.01

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