RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.53■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.52■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.52■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.52■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.52■■□□□ 1.68
HLA-B-255ENST00000498007 NUP98P52948 1817 aa25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 TM4SF1P30408 202 aa25.51■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 SLFN5Q08AF3 891 aa25.5■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 HLFQ16534 295 aa25.5■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 COPS6Q7L5N1 327 aa25.5■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 HYPKQ9NX55 129 aa25.49■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 SYT17Q9BSW7 474 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 STK31Q9BXU1 1019 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.48■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.47■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.47■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 SETDB2Q96T68 719 aa25.47■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.47■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.46■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.46■■□□□ 1.67
HLA-B-255ENST00000498007 RGL2O15211 777 aa25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 VAMP4O75379 141 aa25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 SERPINB2P05120 415 aa25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.44■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 ATP10DQ9P241 1426 aa25.44■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 FAM177BA6PVY3 158 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 NPHP1O15259 732 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 GPTP24298 496 aa25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.41■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.4■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 SLC4A2P04920 1241 aa25.4■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.4■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.4■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 CACNA1FO60840 1977 aa25.39■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.39■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 CNBD1Q8NA66 436 aa25.39■■□□□ 1.66
HLA-B-255ENST00000498007 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 G2E3Q7L622 706 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.38■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.37■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 ST5P78524 1137 aa25.36■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.36■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.35■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 FLIIQ13045 1269 aa25.34■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 TCIRG1Q13488 830 aa25.34■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 PARP10Q53GL7 1025 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 SUSD4Q5VX71 490 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF428Q96B54 188 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 NYXQ9GZU5 481 aa25.33■■□□□ 1.65
HLA-B-255ENST00000498007 ADCY9O60503 1353 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0G2JLW4 131 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 TGFB2P61812 414 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 DPEP1P16444 411 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 MYD88Q99836 296 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 ABCC12Q96J65 1359 aa25.31■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 NTSR2O95665 410 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 CHRNA5P30532 468 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 KSR2Q6VAB6 950 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 NLRP10Q86W26 655 aa25.3■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.29■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.29■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
HLA-B-255ENST00000498007 ERFEQ4G0M1 354 aa25.28■■□□□ 1.64
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