RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 PCNTO95613 3336 aa22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF26B4DH59 902 aa22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 NPHP1O15259 732 aa22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 C21orf2O43822 256 aa22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 ST5P78524 1137 aa22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF15Q8N660 670 aa22.5■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.49■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 FSTL1Q12841 308 aa22.48■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 GLTPD2A6NH11 291 aa22.47■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 SRGNP10124 158 aa22.47■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.47■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.47■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.47■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.47■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 HTRA3P83110 453 aa22.46■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 STYK1Q6J9G0 422 aa22.46■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SKIV2L-211ENST00000485349 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 NEFMP07197 916 aa22.44■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 NUP98P52948 1817 aa22.44■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 CNKSR1Q969H4 720 aa22.44■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 MASTLQ96GX5 879 aa22.44■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 NFE2L2Q16236 605 aa22.43■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.42■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 HLFQ16534 295 aa22.42■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.42■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.42■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 RGL2O15211 777 aa22.41■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 ERFEQ4G0M1 354 aa22.41■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM177BA6PVY3 158 aa22.4■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 IFFO2Q5TF58 517 aa22.4■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.39■■□□□ 1.18
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 POTECB2RU33 542 aa22.38■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 SOGA3Q5TF21 947 aa22.38■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.38■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 NGEFQ8N5V2 710 aa22.38■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 NPR1P16066 1061 aa22.37■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.37■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ABCC12Q96J65 1359 aa22.37■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.36■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 KLRG1Q96E93 195 aa22.36■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MYL6BP14649 208 aa22.35■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC93Q567U6 631 aa22.35■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.35■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.34■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 OLFM4Q6UX06 510 aa22.34■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.33■■□□□ 1.17
SKIV2L-211ENST00000485349 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.32■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.32■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.32■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.31■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.31■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SCN4AP35499 1836 aa22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 GPTP24298 496 aa22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 RALBP1Q15311 655 aa22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 JMYQ8N9B5 988 aa22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 NYXQ9GZU5 481 aa22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SNED1Q8TER0 1413 aa22.3■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 RIPK4P57078 832 aa22.29■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CRY2Q49AN0 593 aa22.29■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ERBB4Q15303 1308 aa22.29■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.28■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 POTEIP0CG38 1075 aa22.28■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 POTEJP0CG39 1038 aa22.28■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.28■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.28■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ALDH1B1P30837 517 aa22.27■■□□□ 1.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 SUSD4Q5VX71 490 aa22.26■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.26■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.26■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 PDIA6Q15084 440 aa22.25■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.25■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 COL4A5P29400 1685 aa22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 NTSR2O95665 410 aa22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 PROSER3Q2NL68 480 aa22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 CHADLQ6NUI6 762 aa22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 SLC51AQ86UW1 340 aa22.24■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 LAMB2P55268 1798 aa22.23■■□□□ 1.15
SKIV2L-211ENST00000485349 ANXA1P04083 346 aa22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms