RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, human

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHKB-210	ENST00000484266	VAMP4	O75379	141 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	DDR1	Q08345	913 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	NFIX	Q14938	502 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		42.41	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	RGL2	O15211	777 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	COPS6	Q7L5N1	327 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	HYPK	Q9NX55	129 aa		42.39	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		42.38	■■■■■ 4.38
CHKB-210	ENST00000484266	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	HLF	Q16534	295 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	42.37	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		42.36	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	42.33	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	CACNA1F	O60840	1977 aa		42.33	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	STK31	Q9BXU1	1019 aa		42.32	■■■■■ 4.37
CHKB-210	ENST00000484266	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		42.32	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	KLHL34	Q8N239	644 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		42.3	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	SETDB2	Q96T68	719 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	SYT17	Q9BSW7	474 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	ATP10D	Q9P241	1426 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	SERPINB2	P05120	415 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	42.26	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		42.26	■■■■■ 4.36
CHKB-210	ENST00000484266	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CHKB-210	ENST00000484266	SLC4A2	P04920	1241 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CHKB-210	ENST00000484266	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CHKB-210	ENST00000484266	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		42.24	■■■■■ 4.35
CHKB-210	ENST00000484266	G2E3	Q7L622	706 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHKB-210	ENST00000484266	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHKB-210	ENST00000484266	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		42.19	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	GPT	P24298	496 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		42.16	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	TCIRG1	Q13488	830 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		42.14	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	42.14	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	42.13	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	FLII	Q13045	1269 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	CNBD1	Q8NA66	436 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	ZNF428	Q96B54	188 aa		42.13	■■■■■ 4.34
CHKB-210	ENST00000484266	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	FAM177B	A6PVY3	158 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	ADCY9	O60503	1353 aa		42.11	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	PARP10	Q53GL7	1025 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	SUSD4	Q5VX71	490 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	KSR2	Q6VAB6	950 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		42.09	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	NPHP1	O15259	732 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	TGFB2	P61812	414 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		42.07	■■■■■ 4.33
CHKB-210	ENST00000484266	NLRP10	Q86W26	655 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	NYX	Q9GZU5	481 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	42.05	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	ST5	P78524	1137 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	NTSR2	O95665	410 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	MYD88	Q99836	296 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		42.02	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	42.01	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266		A0A0G2JLW4	131 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	DPEP1	P16444	411 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CHKB-210	ENST00000484266	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
CHKB-210	ENST00000484266	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
CHKB-210	ENST00000484266	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CHKB-210	ENST00000484266	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	41.99	■■■■■ 4.31
CHKB-210	ENST00000484266	ABCC12	Q96J65	1359 aa		41.99	■■■■■ 4.31
CHKB-210	ENST00000484266	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	41.98	■■■■■ 4.31

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