RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 CHPF2Q9P2E5 772 aa34.35■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 HLFQ16534 295 aa34.34■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 TSPYL6Q8N831 410 aa34.34■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 FANCIQ9NVI1 1328 aa34.34■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 DCAF8L1A6NGE4 600 aa34.33■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF521Q96K83 1311 aa34.33■■■■□ 3.09
GTF3C4-202ENST00000483873 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.32■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SERPINB2P05120 415 aa34.31■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF6Q6ZMV9 814 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 PXDNLA1KZ92 1463 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.3■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.29■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 XAGE3Q8WTP9 111 aa34.28■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 SETDB2Q96T68 719 aa34.28■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa34.27■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 ERVV-1B6SEH8 477 aa34.27■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 COPS6Q7L5N1 327 aa34.27■■■■□ 3.08
GTF3C4-202ENST00000483873 RGL2O15211 777 aa34.26■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.25■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 WWC3Q9ULE0 1092 aa34.24■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.24■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 UTRNP46939 3433 aa34.22■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.22■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP10DQ9P241 1426 aa34.22■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0G2JLW4 131 aa34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 TGFB2P61812 414 aa34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA2Q08379 1002 aa34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 PRR5LQ6MZQ0 368 aa34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.21■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.2■■■■□ 3.07
GTF3C4-202ENST00000483873 DPEP1P16444 411 aa34.2■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 HYPKQ9NX55 129 aa34.2■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR162Q16538 588 aa34.19■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.19■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM177BA6PVY3 158 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 GPTP24298 496 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CNBD1Q8NA66 436 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 DLEC1Q9Y238 1755 aa34.18■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.17■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 CHRNA5P30532 468 aa34.16■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 KCNA3P22001 575 aa34.15■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 YY1P25490 414 aa34.15■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 NPHP1O15259 732 aa34.14■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.14■■■■□ 3.06
GTF3C4-202ENST00000483873 VAMP4O75379 141 aa34.13■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.12■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.12■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.12■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 CACNA1FO60840 1977 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 ST5P78524 1137 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.11■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 E9PSI1 815 aa34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 SLFN5Q08AF3 891 aa34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 STK31Q9BXU1 1019 aa34.1■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 SUSD4Q5VX71 490 aa34.09■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.09■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa34.08■■■■□ 3.05
GTF3C4-202ENST00000483873 TCIRG1Q13488 830 aa34.07■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 CACNA1SQ13698 1873 aa34.07■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.07■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 C2CD5Q86YS7 1000 aa34.07■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 CHD4Q14839 1912 aa34.07■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCC12Q96J65 1359 aa34.07■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.06■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 G2E3Q7L622 706 aa34.06■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 BCS1LQ9Y276 419 aa34.06■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 NYXQ9GZU5 481 aa34.05■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 NTSR2O95665 410 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC4A2P04920 1241 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 PDE6BP35913 854 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 PIM2Q9P1W9 311 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 ERFEQ4G0M1 354 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 PARP10Q53GL7 1025 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF428Q96B54 188 aa34.04■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 H0YIN7 160 aa34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 NLRP10Q86W26 655 aa34.03■■■■□ 3.04
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.01■■■■□ 3.03
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms