RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	MEIS3	Q99687	375 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	COL15A1	P39059	1388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPS18-231	ENST00000472218		A0A087WZG4	1122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	IGHD	P01880	384 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	GRM8	O00222	908 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CEP85	Q6P2H3	762 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	MTX1	Q13505	466 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	GCKR	Q14397	625 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	ITPK1	Q13572	414 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	DCTPP1	Q9H773	170 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	MYD88	Q99836	296 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		13.48	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	TJP1	Q07157	1748 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	RREB1	Q92766	1687 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.47	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	EP400	Q96L91	3159 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218		H7C1W4	665 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	PLSCR1	O15162	318 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	NUCB1	Q02818	461 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RPS18-231	ENST00000472218	RPS6KA4	O75676	772 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	POLA2	Q14181	598 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	BTAF1	O14981	1849 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	FAM182B	Q5T319	152 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	AK7	Q96M32	723 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	CASP7	P55210	303 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	SBF2	Q86WG5	1849 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	TRIM37	O94972	964 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	NLRP10	Q86W26	655 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	LY75	O60449	1722 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RPS18-231	ENST00000472218	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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