RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 HLFQ16534 295 aa31.22■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL7Q6ZT98 887 aa31.22■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC24Q8N4L8 307 aa31.22■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 NECTIN2Q92692 538 aa31.22■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 C2CD5Q86YS7 1000 aa31.21■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 MBIPQ9NS73 344 aa31.21■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 IFT57Q9NWB7 429 aa31.21■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa31.21■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.2■■■□□ 2.59
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF853P0CG23 659 aa31.2■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 GNAI1P63096 354 aa31.2■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 BRIP1Q9BX63 1249 aa31.2■■■□□ 2.59
SMKR1-201ENST00000462322 H0YIN7 160 aa31.19■■■□□ 2.58
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SMKR1-201ENST00000462322 PDE6BP35913 854 aa31.18■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 PROSER3Q2NL68 480 aa31.18■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB3Q9H5J0 574 aa31.18■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 ANXA1P04083 346 aa31.17■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa31.17■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 HOXB7P09629 217 aa31.16■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 FAM177BA6PVY3 158 aa31.15■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.15■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 LRP10Q7Z4F1 713 aa31.15■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa31.15■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 DUSP27Q5VZP5 1158 aa31.14■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 TPTE2Q6XPS3 522 aa31.14■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa31.14■■■□□ 2.58
SMKR1-201ENST00000462322 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa31.13■■■□□ 2.57
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SMKR1-201ENST00000462322 TTLL6Q8N841 843 aa31.13■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP31.13■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 NUP98P52948 1817 aa31.12■■■□□ 2.57
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP31.11■■■□□ 2.57
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SMKR1-201ENST00000462322 CHPF2Q9P2E5 772 aa31.11■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 DLEC1Q9Y238 1755 aa31.1■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
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SMKR1-201ENST00000462322 COPS6Q7L5N1 327 aa31.1■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 WWC1Q8IX03 1113 aa31.1■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.1■■■□□ 2.57
SMKR1-201ENST00000462322 GPTP24298 496 aa31.09■■■□□ 2.57
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SMKR1-201ENST00000462322 SUSD4Q5VX71 490 aa31.02■■■□□ 2.56
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SMKR1-201ENST00000462322 RNF181Q9P0P0 153 aa30.95■■■□□ 2.55
SMKR1-201ENST00000462322 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
SMKR1-201ENST00000462322 NLRP10Q86W26 655 aa30.93■■■□□ 2.54
SMKR1-201ENST00000462322 SLX4Q8IY92 1834 aa30.92■■■□□ 2.54
SMKR1-201ENST00000462322 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.92■■■□□ 2.54
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.92■■■□□ 2.54
SMKR1-201ENST00000462322 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SMKR1-201ENST00000462322 CACNA1SQ13698 1873 aa30.91■■■□□ 2.54
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