RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 CACNA1FO60840 1977 aa24.96■■□□□ 1.59
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SNHG12-201ENST00000461448 KIF16BQ96L93 1317 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 CAMTA2O94983 1202 aa24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.93■■□□□ 1.58
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SNHG12-201ENST00000461448 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.92■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 C4AP0C0L4 1744 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 GYS1P13807 737 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
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SNHG12-201ENST00000461448 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.9■■□□□ 1.58
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SNHG12-201ENST00000461448 MSL1Q68DK7 614 aa24.9■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 KSR2Q6VAB6 950 aa24.9■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.9■■□□□ 1.58
SNHG12-201ENST00000461448 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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SNHG12-201ENST00000461448 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.88■■□□□ 1.57
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SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.88■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.88■■□□□ 1.57
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SNHG12-201ENST00000461448 ADCY9O60503 1353 aa24.86■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 F6X3S4 739 aa24.86■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa24.86■■□□□ 1.57
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SNHG12-201ENST00000461448 MS4A1P11836 297 aa24.85■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.85■■□□□ 1.57
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SNHG12-201ENST00000461448 SCN7AQ01118 1682 aa24.85■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 CASZ1Q86V15 1759 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 MYD88Q99836 296 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 MTFR1LQ9H019 292 aa24.84■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 GPTP24298 496 aa24.83■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 TCIRG1Q13488 830 aa24.83■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 BCORQ6W2J9 1755 aa24.83■■□□□ 1.57
SNHG12-201ENST00000461448 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.83■■□□□ 1.56
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SNHG12-201ENST00000461448 NFIXQ14938 502 aa24.82■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.82■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 SETDB2Q96T68 719 aa24.82■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.81■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 TM4SF1P30408 202 aa24.8■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.8■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.79■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 MMP10P09238 476 aa24.79■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 ATP10DQ9P241 1426 aa24.79■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.79■■□□□ 1.56
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SNHG12-201ENST00000461448 NUP98P52948 1817 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 PLIN1O60240 522 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM27P14373 513 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG12-201ENST00000461448 POLD1P28340 1107 aa24.77■■□□□ 1.56
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SNHG12-201ENST00000461448 DDR1Q08345 913 aa24.76■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 PDE3AQ14432 1141 aa24.76■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 PARP10Q53GL7 1025 aa24.76■■□□□ 1.55
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SNHG12-201ENST00000461448 IGKV5-2P06315 115 aa24.75■■□□□ 1.55
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SNHG12-201ENST00000461448 NLRP10Q86W26 655 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 LINS1Q8NG48 757 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 SERPINB2P05120 415 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 SUSD4Q5VX71 490 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.75■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.74■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.73■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 NPHP1O15259 732 aa24.73■■□□□ 1.55
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.73■■□□□ 1.55
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