RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 TTLL6Q8N841 843 aa27.53■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
LTB-211ENST00000446745 NGEFQ8N5V2 710 aa27.51■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.5■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 MYL6BP14649 208 aa27.5■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 TRIM35Q9UPQ4 493 aa27.5■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.5■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.49■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.48■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 CHL1O00533 1208 aa27.47■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 ANP32CO43423 234 aa27.47■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.46■■□□□ 1.99
LTB-211ENST00000446745 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 C1QTNF8P60827 252 aa27.45■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 NYXQ9GZU5 481 aa27.45■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 NUP98P52948 1817 aa27.44■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 APAF1O14727 1248 aa27.44■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 HLFQ16534 295 aa27.44■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.44■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 CNKSR1Q969H4 720 aa27.44■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 STYK1Q6J9G0 422 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 CFAP44Q96MT7 982 aa27.43■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 TTLL7Q6ZT98 887 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 MASTLQ96GX5 879 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 RNF181Q9P0P0 153 aa27.42■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 FAM177BA6PVY3 158 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 HOXB7P09629 217 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.41■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 SRGNP10124 158 aa27.4■■□□□ 1.98
LTB-211ENST00000446745 SOGA3Q5TF21 947 aa27.38■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 SBF1O95248 1867 aa27.38■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 NPR1P16066 1061 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 LMNB1P20700 586 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 GNAI1P63096 354 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 PDIA6Q15084 440 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 NECTIN2Q92692 538 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 IFT57Q9NWB7 429 aa27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.36■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa27.36■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 MRS2Q9HD23 443 aa27.36■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 C21orf2O43822 256 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 GPTP24298 496 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 PARP10Q53GL7 1025 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 CACNA1SQ13698 1873 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.35■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 RASSF7Q02833 373 aa27.34■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 MBIPQ9NS73 344 aa27.34■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 KRT24Q2M2I5 525 aa27.33■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 PROSER3Q2NL68 480 aa27.33■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 LRP10Q7Z4F1 713 aa27.33■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.33■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 CHMP4AQ9BY43 222 aa27.33■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
LTB-211ENST00000446745 ANXA1P04083 346 aa27.32■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 ZNF853P0CG23 659 aa27.32■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 CCDC184Q52MB2 194 aa27.32■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 COPS6Q7L5N1 327 aa27.32■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 ALDH1B1P30837 517 aa27.31■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.31■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.31■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.31■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 SLX4Q8IY92 1834 aa27.31■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.3■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.3■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.3■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.3■■□□□ 1.96
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LTB-211ENST00000446745 ERFEQ4G0M1 354 aa27.29■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 SUSD4Q5VX71 490 aa27.29■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.29■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 HYPKQ9NX55 129 aa27.29■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.29■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.28■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.28■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.28■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 ABCC12Q96J65 1359 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 KIF3CO14782 793 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 CCDC27Q2M243 656 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 CCDC93Q567U6 631 aa27.27■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
LTB-211ENST00000446745 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
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