RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 FERMT3Q86UX7 667 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.69□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SDSP20132 328 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MBIPQ9NS73 344 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TTLL5Q6EMB2 1281 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 KRT222Q8N1A0 295 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MBD5Q9P267 1494 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CDKL5O76039 1030 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CAVIN2O95810 425 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 LEKR1Q6ZMV7 388 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ZHX3Q9H4I2 956 aa11.68□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ERICH4A6NGS2 130 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 USP26Q9BXU7 913 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 STX6O43752 255 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TIGD1Q96MW7 591 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CFAP45Q9UL16 551 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 UBXN4Q92575 508 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 OGFRQ9NZT2 677 aa11.67□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ODF2Q5BJF6 829 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 USP48Q86UV5 1035 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 NAPBQ9H115 298 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CLIP2Q9UDT6 1046 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 DCTPP1Q9H773 170 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 PTPRCP08575 1304 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MYO5CQ9NQX4 1742 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MAP3K12Q12852 859 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 CCDC83Q8IWF9 413 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.65□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.65□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 SNRKQ9NRH2 765 aa11.65□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 ZRANB1Q9UGI0 708 aa11.65□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.65□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 SERPINC1P01008 464 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 FAM200AQ8TCP9 573 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 USP5P45974 858 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 MKNK2Q9HBH9 465 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 CAMK4Q16566 473 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 CEP135Q66GS9 1140 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 ATP7AQ04656 1500 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 SMTNL1A8MU46 457 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 CTAGE5O15320 804 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
TNS1-209ENST00000446688 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.3 ms