RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ERBB4Q15303 1308 aa35.05■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.01■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 CCDC146Q8IYE0 955 aa35.01■■■■□ 3.2
ODC1-204ENST00000446285 ERVV-1B6SEH8 477 aa35■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 RNF181Q9P0P0 153 aa35■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.99■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 KIF6Q6ZMV9 814 aa34.98■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 CCDC24Q8N4L8 307 aa34.98■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 ADAMTS8Q9UP79 889 aa34.98■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 STYK1Q6J9G0 422 aa34.97■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 CNKSR1Q969H4 720 aa34.97■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP34.97■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 KIF3CO14782 793 aa34.96■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 NUP98P52948 1817 aa34.96■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.96■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.95■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 SRGNP10124 158 aa34.95■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 NEUROD2Q15784 382 aa34.95■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 HLFQ16534 295 aa34.95■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 MASTLQ96GX5 879 aa34.95■■■■□ 3.19
ODC1-204ENST00000446285 LMNB1P20700 586 aa34.94■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 NGEFQ8N5V2 710 aa34.93■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 KDM2BQ8NHM5 1336 aa34.92■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 MYL6BP14649 208 aa34.92■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 RASSF7Q02833 373 aa34.92■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 NYXQ9GZU5 481 aa34.91■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 TRIM35Q9UPQ4 493 aa34.91■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 SOGA3Q5TF21 947 aa34.9■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa34.89■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 CHL1O00533 1208 aa34.89■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 TTLL7Q6ZT98 887 aa34.89■■■■□ 3.18
ODC1-204ENST00000446285 CACNA1SQ13698 1873 aa34.88■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa34.88■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.88■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 NFKBIEO00221 500 aa34.87■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 C21orf2O43822 256 aa34.87■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 NPR1P16066 1061 aa34.87■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 SLX4Q8IY92 1834 aa34.87■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP34.86■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 TOMM70O94826 608 aa34.85■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 NMRK2Q9NPI5 230 aa34.85■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 LTBP3Q9NS15 1303 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 TIAM2Q8IVF5 1701 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 FAM177BA6PVY3 158 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 PDIA6Q15084 440 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.84■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 LRP10Q7Z4F1 713 aa34.83■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
ODC1-204ENST00000446285 RIC1Q4ADV7 1423 aa34.81■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 HOXB7P09629 217 aa34.81■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 CFAP44Q96MT7 982 aa34.81■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 TAOK3Q9H2K8 898 aa34.81■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 HSPA6P17066 643 aa34.8■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 PRELPP51888 382 aa34.8■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.8■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 ALDH1B1P30837 517 aa34.78■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 PARP10Q53GL7 1025 aa34.78■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.78■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 GPTP24298 496 aa34.77■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP34.77■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 ABCC12Q96J65 1359 aa34.76■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 GLTPD2A6NH11 291 aa34.76■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 PROSER3Q2NL68 480 aa34.76■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 CRY2Q49AN0 593 aa34.76■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 CCDC93Q567U6 631 aa34.76■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.76■■■■□ 3.16
ODC1-204ENST00000446285 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
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ODC1-204ENST00000446285 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.75■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 NUTM1Q86Y26 1132 aa34.75■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 ERFEQ4G0M1 354 aa34.74■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 SUSD4Q5VX71 490 aa34.74■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.74■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 NTSR2O95665 410 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 ANXA1P04083 346 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 KRT24Q2M2I5 525 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 COPS6Q7L5N1 327 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 NECTIN2Q92692 538 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 RRAGCQ9HB90 399 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 IFT57Q9NWB7 429 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.72■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa34.71■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 DPY19L2Q6NUT2 758 aa34.71■■■■□ 3.15
ODC1-204ENST00000446285 XAGE3Q8WTP9 111 aa34.71■■■■□ 3.15
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