RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 HLFQ16534 295 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 SETDB2Q96T68 719 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 FAM177BA6PVY3 158 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 KRT24Q2M2I5 525 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 CNBD1Q8NA66 436 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-209ENST00000439106 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
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PRAME-209ENST00000439106 NECTIN2Q92692 538 aa18.15■□□□□ 0.5
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PRAME-209ENST00000439106 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-209ENST00000439106 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
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PRAME-209ENST00000439106 TTLL6Q8N841 843 aa18.12■□□□□ 0.49
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PRAME-209ENST00000439106 C1QTNF8P60827 252 aa18.11■□□□□ 0.49
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PRAME-209ENST00000439106 RNF181Q9P0P0 153 aa18.1■□□□□ 0.49
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PRAME-209ENST00000439106 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.08■□□□□ 0.48
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PRAME-209ENST00000439106 MBIPQ9NS73 344 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 TAF1P21675 1872 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.06■□□□□ 0.48
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PRAME-209ENST00000439106 CFAP44Q96MT7 982 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 MRS2Q9HD23 443 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 KIF3CO14782 793 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 ANP32CO43423 234 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 ERFEQ4G0M1 354 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 SUSD4Q5VX71 490 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 STYK1Q6J9G0 422 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 COPS6Q7L5N1 327 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF428Q96B54 188 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF853P0CG23 659 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 OLFM4Q6UX06 510 aa18.02■□□□□ 0.48
PRAME-209ENST00000439106 CNKSR1Q969H4 720 aa18.02■□□□□ 0.48
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PRAME-209ENST00000439106 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 NTSR2O95665 410 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 NPR1P16066 1061 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 LMNB1P20700 586 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.01■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 SLC51AQ86UW1 340 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 NYXQ9GZU5 481 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 IFT57Q9NWB7 429 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 GNAI1P63096 354 aa17.99■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.98■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 HOXB7P09629 217 aa17.98■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 TAOK3Q9H2K8 898 aa17.98■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-209ENST00000439106 C7orf43Q8WVR3 580 aa17.97■□□□□ 0.47
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