RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 IP6K1Q92551 441 aa22.01■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.01■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM94Q12767 1356 aa22■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 DMTNQ08495 405 aa22■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 SGSM2O43147 1006 aa21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 RASEFQ8IZ41 740 aa21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA1FO60840 1977 aa21.99■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 AK2P54819 239 aa21.98■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC14Q96N46 770 aa21.98■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 SRGAP3O43295 1099 aa21.98■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.98■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 DTNBO60941 627 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM4AO75164 1064 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 GCP02774 474 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF4Q96M43 638 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 MAP3K5Q99683 1374 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 CPA1P15085 419 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 POLA2Q14181 598 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 RUFY3Q7L099 469 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 SPG7Q9UQ90 795 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF3AQ9Y496 699 aa21.97■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB11FIP3O75154 756 aa21.96■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 SYT1P21579 422 aa21.96■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2HP62256 183 aa21.96■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.96■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RALGPS1-208ENST00000424082 STX6O43752 255 aa21.95■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM177BA6PVY3 158 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF3P18847 181 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 FIBPO43427 364 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 LARGE1O95461 756 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTROBQ8N137 903 aa21.94■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.93■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.93■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 MST1RQ04912 1400 aa21.93■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 CBX1P83916 185 aa21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 F13A1P00488 732 aa21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.92■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.91■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP2B3Q16720 1220 aa21.91■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.91■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 AP5Z1O43299 807 aa21.9■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.9■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.9■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 SLIT3O75094 1523 aa21.89■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 PI4KAP2A4QPH2 592 aa21.89■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.89■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL34Q8N239 644 aa21.89■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.89■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.89■■□□□ 1.1
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCB2Q00722 1185 aa21.89■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 ADCK5Q3MIX3 580 aa21.89■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.89■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.89■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 HYPKQ9NX55 129 aa21.89■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.89■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 ANXA1P04083 346 aa21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 PTH1RQ03431 593 aa21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 BEND3Q5T5X7 828 aa21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 TPM3P06753 285 aa21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 GJB2P29033 226 aa21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.87■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.87■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.87■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF1AQ12756 1690 aa21.87■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RALGPS1-208ENST00000424082 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms