RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 PDE6BP35913 854 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-202ENST00000414620 ST5P78524 1137 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-202ENST00000414620 NGEFQ8N5V2 710 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-202ENST00000414620 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ACTB-202ENST00000414620 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-202ENST00000414620 PRELPP51888 382 aa20.52■□□□□ 0.88
ACTB-202ENST00000414620 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 FAM177BA6PVY3 158 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 HSPA6P17066 643 aa20.51■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 C21orf2O43822 256 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 NFKBIEO00221 500 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 RIPK4P57078 832 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 HLFQ16534 295 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.49■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 MYL6BP14649 208 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 LMNB1P20700 586 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.48■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 TOMM70O94826 608 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 RRAGCQ9HB90 399 aa20.47■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 SRGNP10124 158 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 WDR90Q96KV7 1748 aa20.46■□□□□ 0.87
ACTB-202ENST00000414620 NEUROD2Q15784 382 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 STYK1Q6J9G0 422 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 CNKSR1Q969H4 720 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 MASTLQ96GX5 879 aa20.45■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.44■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.43■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 RGL2O15211 777 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 ABCC12Q96J65 1359 aa20.42■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 GPTP24298 496 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.41■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 ANXA1P04083 346 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 NPR1P16066 1061 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-202ENST00000414620 GLTPD2A6NH11 291 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 ERFEQ4G0M1 354 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 NECTIN2Q92692 538 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 RUNDC1Q96C34 613 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 ERBB4Q15303 1308 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 LAMB2P55268 1798 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 APLP1P51693 650 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 KRT24Q2M2I5 525 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 PROSER3Q2NL68 480 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 OLFM4Q6UX06 510 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 NYXQ9GZU5 481 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 CCDC93Q567U6 631 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 SOGA3Q5TF21 947 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 PDIA6Q15084 440 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 SUSD4Q5VX71 490 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 HTRA3P83110 453 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 FSTL1Q12841 308 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 DPY19L2Q6NUT2 758 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-202ENST00000414620 CEP350Q5VT06 3117 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 NTSR2O95665 410 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 POTECB2RU33 542 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 CHL1O00533 1208 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 ALDH1B1P30837 517 aa20.31■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 13.5
ACTB-202ENST00000414620 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 TAF1P21675 1872 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-202ENST00000414620 SCN4AP35499 1836 aa20.3■□□□□ 0.84
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