RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 NGEFQ8N5V2 710 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 SSH2Q76I76 1423 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF521Q96K83 1311 aa8.02□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 MON2Q7Z3U7 1717 aa8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 TIMP2P16035 220 aa8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 NNTQ13423 1086 aa8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP7Q8WX94 980 aa8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 NUDCQ9Y266 331 aa8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 SHPRHQ149N8 1683 aa8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 AKAP12Q02952 1782 aa8□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 MAN1A2O60476 641 aa8□□□□□ -1.13
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C6orf48-208ENST00000395788 MTHFSP49914 203 aa8□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 SH3BP2P78314 561 aa8□□□□□ -1.13
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C6orf48-208ENST00000395788 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 FBXO41Q8TF61 875 aa8□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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C6orf48-208ENST00000395788 NWD1Q149M9 1564 aa8□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ADH1CP00326 375 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 JUNDP17535 347 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 SVOPQ8N4V2 548 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 MPNDQ8N594 471 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.99□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
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C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF15O94989 841 aa7.98□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 WDR4P57081 412 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.98□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 CFAP53Q96M91 514 aa7.98□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.97□□□□□ -1.13
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C6orf48-208ENST00000395788 FMN2Q9NZ56 1722 aa7.97□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ACEP12821 1306 aa7.97□□□□□ -1.13
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C6orf48-208ENST00000395788 USP31Q70CQ4 1352 aa7.97□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa7.96□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 OVOS2Q6IE36 1432 aa7.96□□□□□ -1.13
C6orf48-208ENST00000395788 ITSN1Q15811 1721 aa7.96□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.96□□□□□ -1.14
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C6orf48-208ENST00000395788 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC27Q2M243 656 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 NME9Q86XW9 330 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 RUNDC1Q96C34 613 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 PHOX2BQ99453 314 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 NALCNQ8IZF0 1738 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.95□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 APAF1O14727 1248 aa7.94□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 MSTNO14793 375 aa7.94□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 NEFLP07196 543 aa7.94□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.94□□□□□ -1.14
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C6orf48-208ENST00000395788 PLEKHF1Q96S99 279 aa7.94□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 USP54Q70EL1 1684 aa7.94□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 KDM4AO75164 1064 aa7.93□□□□□ -1.14
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C6orf48-208ENST00000395788 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.93□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 COG3Q96JB2 828 aa7.93□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 GNPATO15228 680 aa7.92□□□□□ -1.14
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C6orf48-208ENST00000395788 CD46P15529 392 aa7.92□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 IL13P35225 146 aa7.92□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.92□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC146Q8IYE0 955 aa7.92□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.92□□□□□ -1.14
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C6orf48-208ENST00000395788 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.91□□□□□ -1.14
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C6orf48-208ENST00000395788 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 WDR63Q8IWG1 891 aa7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 WWC1Q8IX03 1113 aa7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 TCP11L2Q8N4U5 519 aa7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.91□□□□□ -1.14
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
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