RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384406.1

RNU6-452P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 452, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-452P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-452P-201ENST00000384406 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 SIAH2O43255 324 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ATP2B1P20020 1258 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CLN3Q13286 438 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 IFT43Q96FT9 208 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 GMLQ99445 158 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ADH1AP07327 375 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 SPG7Q9UQ90 795 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 FAM13BQ9NYF5 915 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CABP1Q9NZU7 370 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 NR3C2P08235 984 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CTSHP09668 335 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CENPCQ03188 943 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 KCNC4Q03721 635 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 TTC16Q8NEE8 873 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 LNPKQ9C0E8 428 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 KLK14Q9P0G3 267 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 GIPC1O14908 333 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 ORC1Q13415 861 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 TREML1Q86YW5 311 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-452P-201ENST00000384406 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 TNNI2P48788 182 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 ARID5AQ03989 594 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 GPR152Q8TDT2 470 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 WNT7AO00755 349 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 PTGIRP43119 386 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 HIF1AQ16665 826 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 NLRP3Q96P20 1036 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 OPLAHO14841 1288 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 RBL2Q08999 1139 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 C8orf34Q49A92 452 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 SOGA3Q5TF21 947 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 USP48Q86UV5 1035 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 C12orf49Q9H741 205 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 ZNF394Q53GI3 561 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 Q6ZVU0 165 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 VPS37DQ86XT2 251 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 BCS1LQ9Y276 419 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 USP31Q70CQ4 1352 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 MEN1O00255 615 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 MICAL2O94851 1124 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 XKR5Q6UX68 686 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 CBLBQ13191 982 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 NNTQ13423 1086 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 IER5Q5VY09 327 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-452P-201ENST00000384406 PPP1R18Q6NYC8 613 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms