RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366976.3

NSL1-201, Transcript of NSL1, MIS12 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NSL1, Length 722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1-201ENST00000366976 NEUROD2Q15784 382 aa20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 CCDC27Q2M243 656 aa20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.3■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 APAF1O14727 1248 aa20.29■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 ZNF853P0CG23 659 aa20.29■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 PDE6BP35913 854 aa20.29■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 GNAI1P63096 354 aa20.27■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 NGEFQ8N5V2 710 aa20.27■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 IFT57Q9NWB7 429 aa20.27■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.27■□□□□ 0.84
NSL1-201ENST00000366976 H0YIN7 160 aa20.26■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.26■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 BCORQ6W2J9 1755 aa20.26■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.26■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 PDIA6Q15084 440 aa20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 CNBD1Q8NA66 436 aa20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 BCS1LQ9Y276 419 aa20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 ST5P78524 1137 aa20.24■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.24■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 MRS2Q9HD23 443 aa20.24■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 CCDC184Q52MB2 194 aa20.23■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 SLC4A2P04920 1241 aa20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 TTLL6Q8N841 843 aa20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 NYXQ9GZU5 481 aa20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 CHRNA5P30532 468 aa20.21■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.21■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 MBIPQ9NS73 344 aa20.21■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 IL16Q14005 1332 aa20.21■□□□□ 0.83
NSL1-201ENST00000366976 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.2■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 KIF3CO14782 793 aa20.2■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 MYL6BP14649 208 aa20.2■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 HLFQ16534 295 aa20.2■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 STYK1Q6J9G0 422 aa20.2■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 NPHP1O15259 732 aa20.19■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 PARP10Q53GL7 1025 aa20.19■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.19■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 CNKSR1Q969H4 720 aa20.19■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 SRGNP10124 158 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 WDR90Q96KV7 1748 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.18■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.17■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.17■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 WWC1Q8IX03 1113 aa20.17■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 MASTLQ96GX5 879 aa20.17■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 HYPKQ9NX55 129 aa20.17■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.16■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 SOGA3Q5TF21 947 aa20.16■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 WDR63Q8IWG1 891 aa20.16■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 COPS6Q7L5N1 327 aa20.15■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa20.15■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
NSL1-201ENST00000366976 NPR1P16066 1061 aa20.14■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 ALDH1B1P30837 517 aa20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 PROSER3Q2NL68 480 aa20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 CRY2Q49AN0 593 aa20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 NUP98P52948 1817 aa20.13■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.12■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 TCIRG1Q13488 830 aa20.12■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 KRT24Q2M2I5 525 aa20.12■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.12■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.12■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.11■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 APLP1P51693 650 aa20.11■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.11■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.11■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.1■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.1■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.1■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 NTSR2O95665 410 aa20.09■□□□□ 0.81
NSL1-201ENST00000366976 LMNB1P20700 586 aa20.09■□□□□ 0.81
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