RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KANK3Q6NY19 840 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANTXR1Q9H6X2 564 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPAMQ9HCL2 828 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPRHQ9HD43 1115 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF446Q9NWS9 450 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CACNA1CQ13936 2221 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MED13LQ71F56 2210 aa-1.91□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEURL4Q96JN8 1562 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT86O43790 486 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C8BP07358 591 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HKR1P10072 659 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NCLP19338 710 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MT3P25713 68 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FAM189BP81408 668 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PURAQ00577 322 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM132AQ24JP5 1023 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXB2Q5VYV0 432 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASPHD2Q6ICH7 369 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAYNQ6UX15 382 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CILP2Q8IUL8 1156 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CYSTM1Q9H1C7 97 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARMCX1Q9P291 453 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-1.92□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAM11O75078 769 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R37O75864 691 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRH1P02810 166 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CFC1BP0CG36 223 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RAG2P55895 527 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAM15Q13444 863 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAGSQ8N159 534 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRELD1Q96HD1 420 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AJUBAQ96IF1 538 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PELI2Q9HAT8 420 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZFP57Q9NU63 452 aa-1.93□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LTBP2Q14767 1821 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNRQ92752 1358 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ANKRD33BA6NCL7 494 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRG2P13727 222 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD6P30203 668 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FOXK1P85037 733 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POU4F2Q12837 409 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SEMA3FQ13275 785 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHADLQ6NUI6 762 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GGNQ86UU5 652 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YEATS2Q9ULM3 1422 aa-1.94□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NSD2O96028 1365 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP9BO43861 1147 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HNF1AP20823 631 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 YY1P25490 414 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CDR1P51861 262 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADGRE1Q14246 886 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LAGE3Q14657 143 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL19A1Q14993 1142 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSRP2Q16527 193 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEK8Q86SG6 692 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC13Q8NBP0 860 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIF12Q96FN5 646 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WBP1Q96G27 269 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAP6Q96JE9 813 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD248Q9HCU0 757 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRDM8Q9NQV8 689 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAGPAQ9UK23 515 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-1.95□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FMN1Q68DA7 1419 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SYN1P17600 705 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ASIPP42127 132 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP12-3P60328 96 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRT85P78386 507 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZXDAP98168 799 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TROAPQ12815 778 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPN12Q6ZSI9 719 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC01599Q8WXQ3 324 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KAT6AQ92794 2004 aa-1.96□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NOBOXO60393 691 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 COL6A2P12110 1019 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CSF2RBP32927 897 aa-1.97□□□□□ -2.72
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KLK7P49862 253 aa-1.97□□□□□ -2.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms