RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PDE4D-201ENST00000309641 SLC4A2P04920 1241 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 MMP10P09238 476 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D9BQ66K14 1250 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 BICDL1Q6ZP65 573 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 BCL2L13Q9BXK5 485 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 SCN7AQ01118 1682 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 A0A087WZG4 1122 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 DDR1Q08345 913 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 NFIXQ14938 502 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF428Q96B54 188 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 UTRNP46939 3433 aa11.7□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 TM4SF1P30408 202 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 HYPKQ9NX55 129 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 BCORQ6W2J9 1755 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 COL24A1Q17RW2 1714 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 STK31Q9BXU1 1019 aa11.69□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.68□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 NUP98P52948 1817 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 ERVV-1B6SEH8 477 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 GPTP24298 496 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 FLIIQ13045 1269 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.67□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 FAM177BA6PVY3 158 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 POLD1P28340 1107 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC4GQ6UXB4 293 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.66□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 PI4KAP2A4QPH2 592 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 RARSP54136 660 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 ADCY9O60503 1353 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 LRP5O75197 1615 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 F6X3S4 739 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 SERPINB2P05120 415 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL34Q8N239 644 aa11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PDE4D-201ENST00000309641 BCAR3O75815 825 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 SETDB2Q96T68 719 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 SMC4Q9NTJ3 1288 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 TCIRG1Q13488 830 aa11.64□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ALDH1L2Q3SY69 923 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 SUSD4Q5VX71 490 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 KSR2Q6VAB6 950 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 SYNE4Q8N205 404 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CACNA1FO60840 1977 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ATP10DQ9P241 1426 aa11.63□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NLRP10Q86W26 655 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NLGN2Q8NFZ4 835 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 MYD88Q99836 296 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 RGL2O15211 777 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV5-2P06315 115 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NRXN2Q9P2S2 1712 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 SYT17Q9BSW7 474 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 TNNQ9UQP3 1299 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.61□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NTSR2O95665 410 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ERFEQ4G0M1 354 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CNBD1Q8NA66 436 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ABCC12Q96J65 1359 aa11.6□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 NPHP1O15259 732 aa11.59□□□□□ -0.55
PDE4D-201ENST00000309641 CHRNA5P30532 468 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms