RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 MYD88Q99836 296 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 HMMRO75330 724 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 KAZALD1Q96I82 304 aa11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 GRM8O00222 908 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 ATRNO75882 1429 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 GCKRQ14397 625 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 SSH3Q8TE77 659 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD3NLO95772 234 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 NEXNQ0ZGT2 675 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 POLA2Q14181 598 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 EP400Q96L91 3159 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A0G2JS52 829 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 APBB1O00213 710 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 MTX1Q13505 466 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SUCLG2Q96I99 432 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SRGAP3O43295 1099 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM182BQ5T319 152 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SIK1P57059 783 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 PALLDQ8WX93 1383 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP7P55210 303 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPK1Q13572 414 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 RREB1Q92766 1687 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SEC24BO95487 1268 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ATP6V1AP38606 617 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 BTAF1O14981 1849 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SBF2Q86WG5 1849 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF831Q5JPB2 1677 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 NHSQ6T4R5 1651 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A087WZG4 1122 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 ISCA1Q9BUE6 129 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 COL15A1P39059 1388 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 H7C1W4 665 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 TCIRG1Q13488 830 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-201ENST00000284957 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 CRKLP46109 303 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 HLFQ16534 295 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF5P55010 431 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 NUP98P52948 1817 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC87Q9NVE4 849 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNQ4P56696 695 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB11FIP3O75154 756 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXO4P98177 505 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC22Q5TAA0 569 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 ARXQ96QS3 562 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGEF1-201ENST00000284957 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms