RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 HYPKQ9NX55 129 aa22.39■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 IL17REQ8NFR9 667 aa22.39■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.39■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 MTMR6Q9Y217 621 aa22.39■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 KIF3AQ9Y496 699 aa22.38■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.38■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 PYCARDQ9ULZ3 195 aa22.38■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 CACNA1FO60840 1977 aa22.37■■□□□ 1.17
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CNIH3-201ENST00000272133 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.37■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 SPC24Q8NBT2 197 aa22.37■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 EID1Q9Y6B2 187 aa22.37■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.36■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 PTH1RQ03431 593 aa22.36■■□□□ 1.17
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CNIH3-201ENST00000272133 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.34■■□□□ 1.17
CNIH3-201ENST00000272133 MAP3K5Q99683 1374 aa22.33■■□□□ 1.17
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CNIH3-201ENST00000272133 VPS53Q5VIR6 699 aa22.32■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.31■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 TBX22Q9Y458 520 aa22.31■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.29■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 FERMT3Q86UX7 667 aa22.29■■□□□ 1.16
CNIH3-201ENST00000272133 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 LIG1P18858 919 aa22.27■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.27■■□□□ 1.16
CNIH3-201ENST00000272133 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.27■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.27■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 PTGS1P23219 599 aa22.27■■□□□ 1.16
CNIH3-201ENST00000272133 HOXC9P31274 260 aa22.27■■□□□ 1.16
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CNIH3-201ENST00000272133 NWD1Q149M9 1564 aa22.26■■□□□ 1.15
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CNIH3-201ENST00000272133 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.26■■□□□ 1.15
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CNIH3-201ENST00000272133 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.26■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 NLRP6P59044 892 aa22.26■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 NECTIN1Q15223 517 aa22.26■■□□□ 1.15
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CNIH3-201ENST00000272133 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.24■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 KCNB2Q92953 911 aa22.24■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.24■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.24■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CNIH3-201ENST00000272133 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
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