RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 AK7Q96M32 723 aa9.89□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 MEIS3Q99687 375 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 EVI5LQ96CN4 794 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.88□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 RFX7Q2KHR2 1363 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 FBLN1P23142 703 aa9.87□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 C3P01024 1663 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC158Q5M9N0 1113 aa9.86□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CHPF2Q9P2E5 772 aa9.86□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 COL15A1P39059 1388 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 PHF14O94880 888 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 DDB1Q16531 1140 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.85□□□□□ -0.83
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PTPN3-201ENST00000262539 ABCC12Q96J65 1359 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPN3-201ENST00000262539 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.82□□□□□ -0.84
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PTPN3-201ENST00000262539 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
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PTPN3-201ENST00000262539 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.81□□□□□ -0.84
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PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 EYA2O00167 538 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 UTYO14607 1347 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PTPN3-201ENST00000262539 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
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