RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253339.9

LATS1-201, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LATS1, Length 4,256 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-201ENST00000253339 TBX4P57082 545 aa4.6□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 LONRF3Q496Y0 759 aa4.6□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 SAP130Q9H0E3 1048 aa4.6□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 RBSNQ9H1K0 784 aa4.6□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 GOLGA6L22H0YM25 854 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 ORC1Q13415 861 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 ARID5BQ14865 1188 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 COL19A1Q14993 1142 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 GPR152Q8TDT2 470 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 PPCSQ9HAB8 311 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 POLIQ9UNA4 740 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 PDILTQ8N807 584 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 ARMC2Q8NEN0 867 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 EDEM1Q92611 657 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.59□□□□□ -1.67
LATS1-201ENST00000253339 RIMBP2O15034 1052 aa4.59□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.59□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.59□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.59□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 GPR182O15218 404 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 GYS2P54840 703 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 BECN1Q14457 450 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SIX5Q8N196 739 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 STIM2Q9P246 746 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 A6NHS1 94 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SYCP2LQ5T4T6 812 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 LYPD8Q6UX82 237 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 HOMER1Q86YM7 354 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 EID1Q9Y6B2 187 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 DDAH1O94760 285 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SEPT6Q14141 434 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ESYT3A0FGR9 886 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ARMC5Q96C12 935 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.58□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 PDGFRBP09619 1106 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 MTERF2Q49AM1 385 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 RELL1Q8IUW5 271 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 TTC13Q8NBP0 860 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 DNAJC7Q99615 494 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 IER2Q9BTL4 223 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ERICH6BQ5W0A0 696 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 KIAA0825Q8IV33 1275 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ABTB2Q8N961 1025 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 SNTG2Q9NY99 539 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 TONSLQ96HA7 1378 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 TRIM63Q969Q1 353 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 COPRSQ9NQ92 184 aa4.57□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ETFBP38117 255 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 MTMR8Q96EF0 704 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 INTUQ9ULD6 942 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 AKAP2Q9Y2D5 859 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 NRDCO43847 1150 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 RBL2Q08999 1139 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 PI16Q6UXB8 463 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 CHRDL2Q6WN34 429 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 DCBLD2Q96PD2 775 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 ATG3Q9NT62 314 aa4.56□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.55□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 BACH1O14867 736 aa4.55□□□□□ -1.68
LATS1-201ENST00000253339 FBXO24O75426 580 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms